Cahier de texte
22-06-2021 : Ch2 Communications cellulaires au cours du DE
- Induction de la régionalisation des feuillets au stade gastrula
- La régionalisation dorso-ventrale de l’embryon
- mise en évidence du rôle inducteur de la lèvre dorsale du blastopore
- le centre organisateur de Spemann induit la dorsalisation de l’embryon
- Un double gradient de facteurs paracrines à l’origine de la régionalisation dorso-ventrale de l’embryon
- La régionalisation antéro-postérieure de l’embryon
- la régionalisation gauche-droite de l’embryon
- bilan de la mise en place du plan d’organisation primaire de l’embryon
- importance des inductions cellulaires
- déterminisme versus plasticité des cellules
- Régionalisation de l'embryon au stade organogenèse : exemple des somites
- Formation des somites
- Régionalisation des somites selon l’axe antéropostérieur
- Mise en évidence d’une détermination précoce des somites
- influence des gènes homéotiques sur la régionalisation des somites
- Origine de l’expression séquentielle des gènes homéotiques
19-06-2021 : Ch1 Grandes étapes du DE chez l'amphibien
- L'organogenèse : mise en place des organes
- Neurulation et régionalisation de l’ectoderme
- Régionalisation du mésoderme
- Régionalisation de l’endoderme
19-06-2021 : Ch2 Les communications cellulaires au cours du DE
- Modalités de la communication paracrine
- Utilisation de facteurs diffusant dans le milieu extracellulaire
- Notion d’induction cellulaire
- Méthodes permettant de suivre l'expression d'un gène et de qualifier ses effets phénotypiques
- Importance du croissant gris dans la formation du dos de l’embryon
- Les expériences historiques menées sur le croissant gris
- Explications moléculaires : la redistribution de déterminants cytoplasmiques au niveau du croissant gris
- Equivalence des noyaux et non-équivalence des cytoplasmes au stade morula
- Induction de la formation et de la régionalisation du mésoderme au stade blastula
- Mise en évidence de l’induction du mésoderme
- Mise en évidence de l’induction de la régionalisation dorso-ventrale du mésoderme
- Identification des facteurs paracrines synthétisés par le centre de Nieuwkoop
- Modèle moléculaire de l’induction du mésoderme
- le centre de Nieuwkoop induit la formation de mésoderme dorsal
- les blastomères végétatifs latéraux et ventraux induisent la formation de mésoderme latéral et ventral
17-06-2021 : Ch1 Grandes étapes du DE chez l'amphibien
- La gastrulation : mise en place des trois feuillets embryonnaires
- Définition d'un feuillet embryonnaire
- Suivi des mouvements gastruléens : la technique des marques colorées
- Invagination de la zone marginale et mise en place du mésoderme
- Extension convergente du PA et mise en place de l’ectoderme
- Rotation du PV et mise en place de l’endoderme
- Devenir de la gastrula tardive : mise en place de la corde et des lames latérales
15-06-2021 : Ch1 Grandes étapes du DE chez l'amphibien
- De l’ovocyte au zygote
- L’ovocyte, une cellule riche en réserves
- Fécondation et modifications de la structure de l’œuf
- La segmentation : formation d’un embryon pluricellulaire
- La morula : divisions synchrones et absence de croissance
- La blastula, une structure hautement organisée
10-06-2021 : Ch3 Diagenèse
- Au cours de leur enfouissement, les sédiments meubles se transforment lentement en roches sédimentaires : c’est la diagenèse
- La diagenèse se déroule dans des dépressions subsidentes : les bassins sédimentaires
- Les bassins sédimentaires se forment dans des contextes tectoniques variés
- La subsidence permet l’accumulation et l’enfouissement des sédiments
- Au cours de la diagenèse, les sédiments sont compactés et subissent des modifications chimiques
- Le faciès d’une roche sédimentaire résulte de ses conditions de formation
- Les roches carbonatées sont classées selon la nature de la phase de liaison
- Les roches de la lignée détritique sont classées selon leur granulométrie
- L’étude des formations sédimentaires permet la prospection des ressources et la compréhension de la mise en place des bassins
- 2.1. Les bassins sédimentaires peuvent être étudiés par forages ou par des méthodes indirectes
- 2.2. Il est possible de reconstituer les variations du niveau marin par étude des formations sédimentaires (stratigraphie séquentielle)
- 2.2.1. Le remplissage sédimentaire d’une marge passive est sous contrôle de multiples facteurs
- 2.2.2. La géométrie des dépôts sédimentaires permet de caractériser certains événements tectoniques (comme un rifting)
- 2.2.3. La géométrie des dépôts sédimentaires post-rifting permet de reconstituer les variations du niveau marin
- 2.2.4. La disposition verticale des sédiments reflète la migration horizontale de la ligne de rivage
08-06-2021 : Ch2 Dépôts sédimentaires
- Les particules en suspension se déposent dans des conditions hydrodynamiques particulières
- La sédimentation détritique s’effectue dans des environnements fluviatiles, lacustres ou marins
- Les dépôts fluviatiles peuvent former des terrasses sédimentaires
- Les dépôts lacustres présentent différents faciès
- L’essentiel de la sédimentation détritique se fait en milieu marin
- Les conditions hydrodynamiques de dépôt conditionnent la géométrie des structures sédimentaires formées
- Les courants gravitaires engendrent des turbidites
- Les ions en solution précipitent et sédimentent essentiellement en milieu marin côtier
- La sédimentation carbonatée résulte souvent d’une bioprécipitation au niveau des marges passives et des îles océaniques
- La sédimentation carbonatée pélagique résulte de l’activité d’organismes planctoniques
- La sédimentation carbonatée ne peut s’effectuer qu’à des profondeurs d’eau relativement faible
- La sédimentation carbonatée de plateforme a lieu surtout au niveau des récifs coralliens
- La sédimentation siliceuse résulte d’une activité planctonique et est inégalement distribuée
- Les roches salines ou évaporites se forment par sursaturation d’eau de mer
05-06-2021 : Ch2 Dépôts sédimentaires
- Les particules en suspension se déposent dans des conditions hydrodynamiques particulières
- La sédimentation détritique s’effectue dans des environnements fluviatiles, lacustres ou marins
- Les dépôts fluviatiles peuvent former des terrasses sédimentaires
- Les dépôts lacustres présentent différents faciès
- L’essentiel de la sédimentation détritique se fait en milieu marin
- Les conditions hydrodynamiques de dépôt conditionnent la géométrie des structures sédimentaires formées
- Les courants gravitaires engendrent des turbidites
03-06-2021 : Ch1 érosion
-
- 2.2 Les ions sont transportés sous forme soluble
- 2.2.1 La solubilité d’un ion est fonction de sa charge et de son rayon atomique
- 2.2.2 Au cours d’une hydrolyse, certains ions partent préférentiellement en solution
- 3. L’érosion est responsable du modelé des paysages
- 3.1 Les chaines de montagnes sont des exemples de paysage sous contrôle tectonique dominant
- 3.2 Les reliefs karstiques sont des exemples de paysage sous contrôle lithologique dominant
- 3.3 Les vallées glaciaires sont des exemples de paysages sous contrôle climatique dominant
01-06-2021 : Ch1 sédimento : l'érosion
- Les matériaux en surface sont soumis à de multiples processus d’altération et d’érosion
- 1.1 Divers facteurs physiques fragmentent les roches
- 1.2 Divers facteurs chimiques hydrolysent ou dissolvent les minéraux des roches
- 1.3 La part respective des facteurs physiques et chimiques dépend de la latitude
- 2. L’érosion emporte les particules et ions solubles libérés par l’altération des roches
- 2.1 Les particules sont transportées par la gravité, le vent ou l’eau
28-05-2021 : Ch5. Bilan des types trophiques
- I. Bilan des types trophiques
- II. Aperçu de la chimiolithotrophie : l'eubactérie nitratante Nitrobacter
28-05-2021 : Ch6 Le métabolisme de l'azote
- I) L'hétérotrophie à l'azote (anabolisme et excrétion de l'azote)
- II) L'autotrophie à l'azote
27-05-2021 : Cours photosynthèse
- Deux grands types photosynthétiques : les plantes en C3 et les plantes en C4
- Une particularité physiologique liée aux propriétés de la Rubisco : la photorespiration
- Les plantes en C4 évitent la photorespiration
27-05-2021 : TP roches sédimentaires
Reconnaissance de roches : charbon, halite, sylvite, différents calcaires, craie, grès, différents gypses, meulière, conglomérat, bauxite, argilite, marne.
26-05-2021 : Cours photosynthèse
- La phase photochimique de la photosynthèse : de l'énergie lumineuse à l'ATP et aux transporteurs réduits
- Capture de l'énergie lumineuse par les antennes collectrices de lumière dans les membranes des thylakoïdes
- Fonctionnement de la chaine photosynthétique : des réactions redox mettent en place un gradient de protons et produisent du pouvoir réducteur
- Utilisation du gradient de protons pour la synthèse d'ATP : couplage osmo-chimique
- La phase non photochimique de la photosynthèse : de l'ATP et des transporteurs réduits à la synthèse de matière organique
- Mise en évidence de la fixation et de l'incorporation de CO2 : l'expérience de Calvin et Benson
- La réduction du CO2 en matière organique : le cycle de Calvin
- Fixation du CO2 par la Rubisco
- Bilan global de la photosynthèse et devenir des trioses phosphates
21-05-2021 : Cours photosynthèse
- Présentation de la feuille, organe photosynthétique des Angiospermes
- Approche expérimentale de la photosynthèse
20-05-2021 : TD ATP synthase
18-05-2021 : TD magmatisme
Exercices de magmatisme en distanciel.
12-05-2021 : Ch3 Le catabolisme oxydatif dans la mitochondrie
- I) Du pyruvate aux coenzymes réduits : le cycle de Krebs
- II) Des acides gras aux coenzymes réduits : hélice de Lynen et cycle de Krebs
- III) De la réoxydation des coenzymes réduites à la synthèse d'ATP
- 1) Le fonctionnement de l’ATP synthase grâce à un gradient de protons
- 2) L’oxydation des coenzymes réduites (« pouvoir réducteur ») permet de créer le gradient de protons
07-05-2021 : Ch2 La glycolyse et les fermentations
- I- Les étapes de la glycolyse
- II- Le contrôle de la glycolyse
- III- Le devenir du pyruvate en milieu anaérobie : les fermentations
06-05-2021 : ch1 Les formes d\'énergie dans la cellule
- I. L'énergie d'hydrolyse de l'ATP
- II. L'énergie de gradient transmembranaire
- III. L'énergie des réactions d'oxydo-réduction
04-05-2021 : Chap3 Magmatisme
- 1. L’ordre de cristallisation des minéraux au sein d’un magma est décrit par les séries de Bowen
- 2. Au sein d’une série magmatique, le magma s’enrichit en alcalins et en silice
- 3. La cristallisation fractionnée est un processus majeur guidant la différenciation magmatique
- 4. La différenciation magmatique peut aussi être due à des mélanges de magmas ou à des contaminations
- 5. Les séries magmatiques diffèrent suivant les contextes géodynamiques
- 5.1 La série tholéiitique s’observe surtout au niveau des dorsales
- 5.2 La série alcaline s’observe surtout au niveau intraplaque (points chauds continentaux, rifts)
- 5.3 La série calco-alcaline s’observe au niveau des zones de subduction et est souvent associée à des éruptions dangereuses
30-04-2021 : Chap2 Magmatisme
- 2.4 Le magma produit s’extrait de la roche-mère et entame son ascension
- 2.5 L’étude de la composition chimique des magmas peut permettre de remonter aux caractéristiques de la péridotite mère (docs commentés dans le PPT)
- 2.5.1 Le diagramme Néodyme-Strontium
- 2.5.2 Les diagrammes multi-élémentaires normalisés
- 2.5.3 Modèle du manteau obtenu par étude de la géochimie des laves
29-04-2021 : Ch2 Magmatisme
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- 2.3.2 Les diagrammes ternaires eutectiques (docs commentés dans le PPT)
27-04-2021 : Ch2 Magmatisme
- 2. La fusion partielle des roches s’accompagne d’un tri géochimique des éléments
- 2.1 Certains éléments se concentrent dans les phases solides, d’autres dans les phases liquides
- 2.2 Les minéraux ayant des structures proches sont miscibles (docs commentés dans le PPT)
- 2.3 Les minéraux ayant des structures différentes sont immiscibles et présentent un comportement eutectique au cours de la fusion (docs commentés dans le PPT)
- 2.3.1 Les diagrammes binaires eutectiques
09-04-2021 : Ch2 Magmatisme
- 1. Suivant les contextes géodynamiques, la fusion partielle des roches présente des modalités et des taux de fusion différents
- 1.1 La fusion partielle de la péridotite se produit dans différents contextes géodynamiques
- 1.1.1 La fusion partielle se produit lorsque le géotherme de la péridotite croise le solidus
- 1.1.2 La fusion au niveau des dorsales et des rifts continentaux est due à une décompression adiabatique
- 1.1.3 La fusion au niveau des points chauds est due à un échauffement isobare
- 1.1.4 La fusion au niveau des zones de subduction est due à une hydratation
- 1.2 La fusion partielle de la croûte continentale (anatexie) a lieu au sein des orogènes de grande dimension
08-04-2021 : TD génétique des diploïdes
Notion de gènes libres ou liés.
06-04-2021 : DS (3h)
Protéasome et fécondation + microARN et lactation.
03-04-2021 : Ch1 Magmatisme
Les manifestations du magmatisme, les principaux contextes géodynamiques du magmatisme et la notion de série magmatique.
02-04-2021 : Diversification des génomes
- Les brassages lors de la méiose et de la fécondation créent de nouveaux assortiments d'allèles
- La méiose : passage d'une cellule-mère diploïde à 4 cellules-filles haploïdes
- Le brassage inter-chromosomique : un assortiment aléatoire des chromosomes de chaque paire
- Le brassage intra-chromosomique : des échanges de fragments de chromatides entre chromosomes homologues
- Le hasard de la fécondation : un nouveau brassage allélique
- Les mécanismes favorisant l'allogamie (exemple des Angiospermes)
- Les transferts horizontaux de gènes sont un autre mécanisme de diversification des génomes
- De nombreux transferts horizontaux de gènes chez les procaryotes
- Des transferts horizontaux de gènes chez les eucaryotes
02-04-2021 : TP roches magmatiques
Roches : basalte, gabbro, diorite, andésite, granodiorite, trachyte, granite, rhyolite, péridotite. Utilisation du diagramme de Streckeisen. Rappels sur la datation relative et absolue.
01-04-2021 : Diversification des génomes
- Les mutations géniques créent de nouveaux allèles
- Origines moléculaires des mutations géniques : des événements ponctuels spontanés
- Les conséquences des mutations géniques à différentes échelles
- Des mutations de plus grande ampleur modifient les combinaisons alléliques
- Les mutations chromosomiques
- Les mutations affectant tout le jeu de chromosomes
01-04-2021 : TP fruits et graines
Homologies et convergences, mode de dissémination, nomenclature des principaux fruits et graines.
30-03-2021 : Soutenances Tipe
26-03-2021 : TD fécondation oursin.
TD Fécondation de l'oursin. Réflexion sur le sujet de TIPE de spé.
25-03-2021 : TP reproduction asexuée
Reproduction asexuée = clonale, par mitoses. Faible diversification = vulnérabilité face aux changements.
Structures spécialisées : bulbilles, stolons, drageons...
Structure non spécialisées : bouturage ou marcottage.
23-03-2021 : La reproduction sexuée
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- c - les barrières à l'autofécondation
- d - la fleur évolue en fruit et le sac embryonnaire en graine
19-03-2021 : La reproduction sexuée
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- 2. La fécondation interne en milieu aérien (fin)
- b - Accouplement et fécondation
- 3. Pollinisation et fécondation chez les Angiospermes
- a – pollinisation par des animaux ou par le vent
- b - la double fécondation des Angiospermes
18-03-2021 : La reproduction sexuée
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- 2. La fécondation interne en milieu aérien (fin)
- b - Accouplement et fécondation
18-03-2021 : TP reproduction des Angiospermes
Dissection, formule et diagramme floral : tulipe, primevère. Correction des dimères de thymine.
16-03-2021 : La reproduction sexuée
- I. La diversité des cycles de reproduction (fin)
- 3. Le cycle d'une Angiosperme
- II. Les modalités de rapprochement des gamètes et la fécondation
- 1. Une fécondation externe possible en milieu aquatique
- 2. La fécondation interne en milieu aérien
12-03-2021 : La reproduction sexuée
- I. La diversité des cycles de reproduction
- 1. Le cycle des Mammifères Euthériens
- 2. Le cycle d'un Filicophyte : le polypode
11-03-2021 : Bilan sur les voies de biosynthèse
Synthèse des phospholipides membranaires, des ADN et ARN, des composés fibreux des MEC et des protéines.
09-03-2021 : Fin TP méthodes de biocell
Western Blot, immunohistochimie, KO et suprexpression de gène. Fabrication d'un OGM végétal, thérapie génique. Exercices sur les cartes de restriction.
Corrigé du TD expression génétique et surdité.
05-03-2021 : La traduction, la maturation et l'adressage des protéines
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- II-2-b) La traduction liée au reticulum endoplasmique
- II-3) Les maturations post-traductionnelles et l’adressage des protéines synthétisées par traduction liée au RER
- II-4) Le recyclage des protéines
04-03-2021 : La traduction, la maturation et l'adressage des protéines
- I- fin
- I-5) Le contrôle de la traduction
- I-5-a) Les interférences à ARN
- I-5-b) La durée de vie des ARNm
- II) Les modifications post-traductionnelles et l'adressage des protéines
- II-1) L’acquisition de la forme de la protéine néosynthétisée grâce à des protéines chaperons
- II-2) L'adressage des protéines néosynthétisées : présence d'une information de position
- II-2-a) La traduction libre
04-03-2021 : TD ADN recombinant
Exercices cartes de restriction de l'ADN
02-03-2021 : La traduction, la maturation et l'adressage des protéines
- I) La traduction : de la séquence nucléotidique à la séquence protéique
- I-1) Les acteurs de la traduction
- I-1-a) Les deux sous-unités ribosomiques
- I-1-b) Les ARNt
- I-2) L’initiation de la traduction
- I-3) L’élongation de la chaine polypeptidique
- I-4) La terminaison de la traduction au niveau d’un codon STOP
11-02-2021 : TP ADN recombinant + fin mitose
Réalisation d'une électrophorèse d'ADN digéré par différentes enzymes de restriction. Principe du clonage degène par utilisation de bactéries recombinantes. Fin du TD mitose : le cycle cellulaire et son contrôle.
11-02-2021 : La transcription et son contrôle
- II) Les maturations post-transcriptionnelles des ARN prémessagers et l’export des ARNm
- II-1) L’addition d’une coiffe 5’ et d’une queue 3’polyadénylée pour les ARNm
- II-2) L’épissage des ARNm
- II-2-a) L’épissage simple
- II-2-b) L’épissage différentiel (= épissage différentiel)
- II-3) L’export des ARNm du noyau vers le cytosol
- III) Le contrôle de la transcription chez les eucaryotes
- III-1) La nécessité de contrôler la transcription
09-02-2021 : La transcription et son contrôle
- I) La transcription : réalisation d’une copie mobile de l’ADN
- I-1) Le principe de la transcription : rôle de la complémentarité des bases
- I-2) L’initiation de la transcription
- I-2-a) L’arrivée d’une ARN polymérase II sur un promoteur en amont du gène
- I-2-b) La stabilisation de l’ARN Pol II par des facteurs de transcription
- I-3) Polymérisation des nucléotides par l'ARN polymérase II
- I-4) La terminaison de la transcription au niveau de séquences spécifiques
- II) Les maturations post-transcriptionnelles des ARN prémessagers et l’export des ARNm
- II-1) L’addition d’une coiffe 5’ et d’une queue 3’polyadénylée pour les ARNm
05-02-2021 : TD mitose
TD mitose : observation de différentes phase de la mitose, marquages moléculaires, docs sur le cycle cellulaire. Schéma bilan final sur la mitose.
04-02-2021 : La réplication de l'ADN
- II) Les mécanismes permettant de conserver l’intégrité du génome (suite et fin)
- 3- La réparation des lésions
04-02-2021 : TD cartographie
Réalisation de coupes à partir de cartes au 50.000e.
02-02-2021 : La réplication de l'ADN
- I) Mécanismes moléculaires de la réplication
- 1- Mise en évidence d’une réplication semi-conservative
- 2- Principe de la réplication : l’ADN polymérase III ajoute des nucléotides en 3’
- 3- Ouverture de l’ADN et formation d’un œil de réplication
- 4- Organisation de la fourche de réplication
29-01-2021 : Un aperçu des virus (HP)
Définition d'un virus, présentation du VMT, du bactériophage lambda et du Sars-CoV2. Cycle du VMT. Principe de la vaccination à ARN (vaccin Pfizer-BioNTech). Exercice d'épistémologie sur la polémique de l'hydroxychloroquine.
28-01-2021 : TD cartographie
Présentation des cartes au 50.000e, légende, type de reliefs (tabulaire, monoclinal, plissé).
Réalisation de coupes à partir de diverses cartes.
26-01-2021 : L'organisation des génomes
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- II-3) Le contenu informatif du génome eucaryote
- II-3-a) Mise en évidence de séquences plus ou moins répétées par dénaturation-renaturation
- II-3-b) La diversité des séquences géniques
- II-3-c) La diversité des séquences intergéniques
- II-4) La présence de gènes morcelés présentant un épissage
- II-5) Le paradoxe de la valeur C
- III) Le génome des mitochondries et des plastes, un génome réduit à hérédité maternelle
- III-1) Des génomes de petite taille mais à rôles métaboliques essentiels
- III-2) Comparaison du génome des organites semi-autonomes avec celui des bactéries
22-01-2021 : L\'organisation des génomes
- I) Le génome des eubactéries, un génome compact(suite)
- I-3) Les échanges de séquences entre bactéries : la conjugaison
- I-4) La régulation de l’expression génétique : un système d’opérons
- I-4-a) Organisation des séquences de l’opéron lactose
- I-4-b) Fonctionnement de l’opéron en absence ou présence de lactose
- I-4-c) Fonctionnement de l’opéron en présence de glucose et de lactose
- II) Le génome eucaryote nucléaire, un génome dispersé riche en séquences répétées
- II-1) L’organisation des chromosomes
- II-1-a) Réalisation d’un caryotype
- II-1-b) Chromosomes homologues et chromatides sœurs
- II-2) Les différents niveaux de condensation de la chromatine interphasique
21-01-2021 : L'organisation des génomes
- I) Le génome des eubactéries, un génome compact
- I-1) Les supports de l’information génétique chez les bactéries
- I-2) Un génome bactérien presque entièrement codant
21-01-2021 : TP enzymes 2
Tracé d'une cinétique par spectrophotométrie (peroxydase et gaïacol). Influence du pH et de la température. Inhibition compétitive et non compétitive.
19-01-2021 : Les enzymes
- III. La régulation de l'activité enzymatique
- Le contrôle par les facteurs physico-chimiques : T, pH
- Le contrôle par des phosphorylations
- Le contrôle par la fixation de ligands
- IV. La nature des enzymes et des réactions qu’elles catalysent contribue à la spécialisation cellulaire
- Une cellule spécialisée sécrète des enzymes particulières, sous contrôle de l’environnement
- Les compartiments cellulaires possèdent des enzymes spécifiques
15-01-2021 : Les enzymes
- II. Les enzymes, des biocatalyseurs permettant des couplages réactionnels (suite)
- Les enzymes allostériques ont une cinétique sigmoïde
14-01-2021 : TP1 Enzymes
Tracé d'une cinétique michaélienne. Utilisation de Rastop.
12-01-2021 : Les enzymes
- I. Les conditions thermodynamiques de réalisation d'une transformation chimique
- Les différentes expressions possibles de ΔrG
- La nécessité de couplages réactionnels
- II. Les enzymes, des biocatalyseurs permettant des couplages réactionnels
- Les enzymes diminuent l’énergie d’activation nécessaire à une réaction
- Les enzymes michaéliennes ont une cinétique hyperbolique
07-01-2021 : La forme de la Terre
- 1. Des analyses gravimétriques utilisant des données satellitaires renseignent sur les hétérogénéités de masse dans le globe
- 1.1 Différents facteurs jouent sur la pesanteur
- 1.2. L’ellipsoïde de référence est une surface mathématiquement définie
- 1.3. Le géoïde est la forme gravimétrique réelle de la Terre
- 1.4 Les anomalies du géoïde par rapport à l’ellipsoïde
- 1.4.1 Les anomalies de grande longueur d’onde du géoïde reflètent la convection profonde
- 1.4.2 Anomalies de petite longueur d’onde du géoïde aident à cartographier les fonds marins
05-01-2021 : Convection et dynamique des enveloppes terrestres
- 1. Origine de la chaleur interne de la Terre : radioactivité et chaleur initiale d’accrétion
- 2. Dissipation de la chaleur interne par conduction ou convection
- 2.1 Transferts de chaleur au sein de la lithosphère : la conduction
- 2.2 Transferts de chaleur au sein du manteau profond : la convection
- 2.2.1 Mise en évidence des cellules de convection par tomographie sismique
- 2.2.2 Modélisation mathématique de la convection : la loi de Rayleigh
- 2.2.3 Convection mantellique et déplacement des plaques lithosphériques
- 2.3 Les modèles de convection mantellique
- 2.4 Etablissement du géotherme
- 3. Inégale répartition de l’énergie solaire reçue et mise en mouvement des enveloppes fluides
- 3.1 Mise en mouvement des vents de surface
- 3.2 Mise en mouvement des eaux océaniques
18-12-2020 : Risques naturels
Définition d'un risque, exemples de risques liés à la géodynamique externe et interne, mesures de prévision et de prévention.
17-12-2020 : Ressources naturelles
Définition de gisement, mine, carrière... Exercices sur l'eau du sahara et l'or dans les Cévennes.
17-12-2020 : TP Géologie
Reconnaissance de roches : péridotite, granite, basalte, gabbro, grès, calcaire.
Exercices variés sur la structure de la Terre.
15-12-2020 : Structure de la Terre
- 1. La Terre possède une structure en enveloppes concentriques
- 1.1. Le modèle radial de la Terre : le modèle PREM
- 1.2. Les différentes enveloppes sont séparées par des discontinuités
- 2. Les enveloppes solides sont de nature silicatée ou métallique
- 2.1. Les minéraux constitutifs des croûtes et du manteau sont essentiellement des minéraux silicatés
- 2.2. Les croûtes continentale et océanique sont d’épaisseurs et de natures différentes
- 2.2.1. La croûte continentale
- 2.2.2. La croûte océanique
- 2.3. Le manteau est constitué de péridotites
- 2.3.1. Les péridotites sont les roches constitutives du manteau
- 2.3.2. Le manteau présente une hétérogénéité verticale
- 2.4. Le noyau est formé d’un alliage de fer et de nickel
- 3. La Terre est entourée d’enveloppes fluides
- 3.1. L’atmosphère planétaire est une enveloppe stratifiée
- 3.2. L’hydrosphère, une enveloppe liquide dynamique et complexe
11-12-2020 : Bilan sur les membranes
Bilan final sur les membranes.
Exercice sur le piment et le récepteur VR1.
Réflexion sur le sujet de synthèse "La membrane plasmique, une interface entre deux milieux".
10-12-2020 : Ch4 Membranes et communication cellulaire
Fin du chapitre, bilan, QCM.
10-12-2020 : TD Carte de France au millionième
Etude des principaux ensembles géologiques de la France à partir de la carte au millionième.
08-12-2020 : Ch4 Membranes et communication cellulaire
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- 2- Les cellules excitables ont des canaux ioniques tensiosensibles à l'origine des PA
- 3- Propagation régénérative du potentiel d'action le long de l'axone
- 4- Cas des neurones myélinisés
- V) La synapse : un relai chimique du message nerveux entre cellules excitables
04-12-2020 : Ch4 Membranes et communication cellulaire
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- 2- Le potentiel d’équilibre d’un ion dépend de facteurs chimiques et électriques (Loi de Nernst)
- 3- Le potentiel de membrane dépend de la perméabilité sélective de la membrane plasmique
- IV) Les potentiels d'action des cellules excitables sont à l'origine du message nerveux électrique
- 1- le potentiel d'action : une ddp au décours stéréotypé se propageant sans atténuation
- 2- Les cellules excitables ont des canaux ioniques tensiosensibles à l'origine des PA
03-12-2020 : Bilan sur les plans d'organisation des animaux
Plans d'organisation et relation organisme/milieu.
Corrigé du DS3.
Exercices de TP sur les microvillosités et présentation de lames de tégument et intestin de mammifère.
01-12-2020 : Ch4 Membranes et communications cellulaires
- I) La communication par le biais de facteurs chimiques diffusibles
- 1- Communication paracrine à courte distance : exemple dans le développement embryonnaire
- 2- Communication hormonale, par la circulation sanguine
- II) L’organisation du système nerveux
- 1- Système nerveux central et périphérique
- 2- Le neurone, une cellule hautement spécialisée
- III) Le potentiel de membrane est dû à des flux ioniques transmembranaires
- 1- Mesure d’une ddp transmembranaire sur un axone de calmar
28-11-2020 : DS Synthèse
L'importance biologique des liaisons faibles
27-11-2020 : Ch3 Membranes et échanges
- Des lois thermodynamiques régissent les échanges transmembranaires
- Les modalités thermodynamiques du passage d’une molécule à travers une membrane dépendent de plusieurs facteurs
- Le passage d’un soluté non chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane
- Le passage de l’eau dépend du potentiel hydrique
- Le passage d’un soluté chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane, de sa charge et de la répartition des charges de part et d’autre de la membrane
- Les transports transmembranaires passifs ne demandent pas d’énergie
- La diffusion simple ne concerne qu’un nombre restreint de molécules
- La diffusion facilitée se fait au moyen de protéines transmembranaires
- Les canaux, non saturables, présentent une cinétique linéaire
- Les transporteurs saturables présentent une cinétique hyperbolique
- Les transports transmembranaires actifs demandent un apport d’énergie chimique
- Les transports actifs primaires utilisent l’énergie d’hydrolyse de l’ATP
- Les transports actifs secondaires utilisent l’énergie de gradient
26-11-2020 : TD Jonctions serrées
Jonctions serrées et toxines bactériennes.
26-11-2020 : TP Dissection de l'écrevisse
Coeur et vaisseaux, appareil reproducteur, appareil digestif, chaine nerveuse abdominale, appendices et branchies.
23-11-2020 : Ch3 Membranes et échanges
- Les particules de grande taille ainsi que certaines molécules sont importées, transportées ou exportées grâce à la formation de vésicules cytosoliques
- Le trafic vésiculaire est à l’origine d’un flux de matière et de membrane au sein des cellules eucaryotes
- Les cytoses permettent les échanges entre la cellule et son milieu
20-11-2020 : Ch2 Membranes, MEC et cytosquelette
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- 3- le peptidoglycane bactérien est une paroi particulière
- Les jonctions intercellulaires des cellules animales assurent des rôles divers
- 1- Les jonctions serrées maintiennent la polarité cellulaire et limitent les flux paracellulaires
- 2- Les jonctions GAP assurent le passage de petites molécules
- 3- Les jonctions adhérentes assurent la cohésion des tissus
- a- ceinture d'adhérence et desmosomes assurent l'adhérence cellule-cellule
- b- les hémidesmosomes et points focaux assurent l'adhérence cellule-matrice
19-11-2020 : Ch3 Membranes, MEC et cytosquelette
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- c- la fibronectine et la laminine pontent les divers éléments de la MEC
- d- imprégnation par des composés minéraux et rigidification : ex de l'os
19-11-2020 : TP Dissection du poisson Téléostéen
Dissection du poisson : écailles (cycloïde + ligne latérale), organes internes (appareil digestif, reproducteur, excréteur), arcs aortiques, observation d'un arc branchial + lamelles sur les filaments branchiaux aux microscope optique.
17-11-2020 : Ch2 Membranes, MEC et cytosquelette
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- b- l'expansine assure la croissance irréversible de la paroi primaire
- c- hémicellulose et pectine pontent les divers éléments de la MEC
- d- les plasmodesmes assurent les échanges entre cellules
- e- la lignification conduit à la mort des cellules et rigidification pariétale
- 2- La matrice extracellulaire animale est un réseau essentiellement protéique
- a- le collagène forme des fibrilles résistantes
- b- l'élastine et les protéoglycanes assurent l'élasticité et l’hydratation de la MEC
13-11-2020 : Ch2 Membranes, MEC et cytosquelette
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- 3- les filaments intermédiaires type kératine assurent le soutien permanent de la cellule
- Les matrices extracellulaires sont des gels hydratés liés fonctionnellement aux cellules
- 1- La matrice extracellulaire végétale désigne la paroi pecto-cellulosique et la lamelle moyenne
- a- la cellulose forme des fibrilles résistantes
12-11-2020 : Ch2 Membranes, MEC et cytosquelette
- Le cytosquelette est responsable de l'architecture et de la dynamique de la cellule
- 1- les microfilaments d'actine assurent le soutien des villosités et la motilité cellulaire
- 2- les microtubules assurent le trafic vésiculaire, les divisions cellulaires et forment cils et flagelles
10-11-2020 : Chapitre 1 Membranes
- 1) Mise en évidence de la composition lipido-protéique et de l'architecture de la membrane
- 2) Mise en évidence de la fluidité membranaire
- 3) Une asymétrie membranaire
- 4) Une perméabilité membranaire sélective
- a- passage des gaz, des lipides et des toutes petites molécules polaires non chargées
- b- nécessité de transports spécifiques pour toutes les autres molécules => voir chapitre échanges
06-11-2020 : AA et protéines
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- Les facteurs pouvant affecter l'activité des protéines
- a- les facteurs physiques : exemples température
- b- les facteurs chimiques : pH ou fixation d'un ligand (ex Ca2+, AMPc)
- Ouverture : Les lipoprotéines sont des assemblages complexes de lipides et protéines
05-11-2020 : AA et protéines
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- L'acquisition de propriétés supplémentaires grâce à une structure quaternaire
05-11-2020 : TP dissection souris
Dissection de la souris : appareil digestif, appareil urogénital, coupe de cartilage.
03-11-2020 : AA et protéines
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- L'organisation tridimensionnelle dépend de la séquence de la protéine et détermine sa fonction
- a- les liaisons faibles et les ponts disulfures réduisent l'agitation thermique des radicaux
- b- les protéines peuvent avoir des domaines transmembranaires (voir cours sur les membranes)
- c- les protéines peuvent être glycosylées : exemple d'une O-glycosylation sur sérine
- La structure IV, un assemblage de plusieurs chaines polypeptidiques
- Les protéines, des macromolécules dynamiques pouvant interagir avec d'autres molécules
- Les interactions ligand-protéine s'établissent grâce à la forme spécifique des protéines
02-11-2020 : AA et protéines
- Propriétés des acides alpha-aminés et réalisation de la liaison peptidique
- Les acides aminés ont un état d’ionisation dépendant du pH
- La diversité des acides aminés repose sur les caractéristiques de leurs radicaux
- La liaison peptidique : une liaison amide plane et peu mobile, établie par condensation
- Les protéines, des polymères présentant différents niveaux structuraux
- Mise en évidence de l’importance de la structure d’une protéine (expérience d’Anfinsen)
- Méthodes d'étude de la structure des protéines : diffraction aux rayons X, RMN, informatique
- La structure primaire des protéines : un enchainement séquencé d'acides aminés
- Les structures secondaires (hélices α et feuillets β) et les domaines fonctionnels
16-10-2020 : Nucléotides et acides nucléiques
- Les différents ARN, relation structure-fonction
- Les ARNm, des intermédiaires mobiles entre l'ADN et la synthèse protéique
- Les ARNt transportent les acides aminés jusqu'au lieu de la traduction
- Les ARNr catalysent la formation de la liaison peptidique
15-10-2020 : Nucléotides et acides nucléiques
- La double hélice d’ADN, relation structure-fonction
- L’ADN : 2 chaines de nucléotides complémentaires
- Réplication de l’ADN selon un modèle semi conservatif
- Le message génétique est contenu dans la séquence nucléotidique
15-10-2020 : TP dissection souris 1
Région cou-thorax + appareil digestif.
13-10-2020 : Nucléotides et AN
- Les nucléotides : des molécules solubles de petite taille à rôles informationnels ou énergétiques
- Le nucléotide : une base azotée reliée à un pentose phosphorylé
- Les nucléotides peuvent s'associer à des protéines
- Rôle de l'ATP dans le métabolisme : une monnaie énergétique
- Rôles des coenzymes redox dans le métabolisme énergétique
- Rôles de la coenzyme A dans le métabolisme énergétique
- Polymérisation des nucléotides et formation d’une liaison 3’5’ phosphodiester
09-10-2020 : Datation
Fin du TD Datation. Fin des exos électrophorèse. Présentation des écoles d'agro, G2E etc.
08-10-2020 : Datation
Datation relative et absolue : Rb/Sr.
06-10-2020 : Les glucides
TD : correction des exos du TP électrophorèse, début de quelques autres exos. Distribution du corrigé du TD thermorégulation.
- Polymérisation des oses en macromolécules aux fonctions variées (fin)
- Des polymères à rôle de structure : cellulose, chitine, glycanes
- Les polymères à rôle informationnel : glycanes
02-10-2020 : Les glucides
- Les oses réagissent par condensation et forment des diosides
- Diversité des liaisons osidiques
- Les diosides peuvent être réducteurs ou non
- Les formes réductrices sont très réactives : maltose alpha, cellobiose bêta,
- Le saccharose, dioside non réducteur, est la forme glucidique circulante privilégiée chez les plantes
- Polymérisation des oses en macromolécules aux fonctions variées
- Des polymères à rôle de réserve : amidon végétal, glycogène animal
01-10-2020 : TP électrophorèse et chromatographie
Chromatographie sur colonne et sur papier, électrophorèse sur gel et sur bande, présentation des Blots.
29-09-2020 : Les glucides
- Les oses sont des molécules chirales et hydrophiles
- Les oses portent une fonction carbonyle et plusieurs fonctions hydroxyle
- Les oses sont des molécules chirales
- Les oses à 5 ou 6 carbones existent sous forme linéaire et cyclique
- Les oses ont des propriétés réductrices
- Les dérivés d'oses
- Synthèse et dégradation des oses au sein du métabolisme cellulaire
- Les oses sont fabriqués à partir du glycéraldéhyde et de la DHAP
- La dégradation des oses constitue une source d'énergie pour les cellules
25-09-2020 : Les lipides
- II) Les rôles biologiques des lipides
- 1) Les triglycérides, des lipides de réserve énergétique (suite et fin)
- 2) Les lipides de structure
- a- les phospholipides membranaires et le cholestérol, composants des membranes biologiques
- b- Les cérides, composants des cires animales et végétales
- 3) Autres rôles des lipides
24-09-2020 : Les lipides
- I) Les lipides, des molécules amphiphiles ou hydrophobes
- Les lipides aliphatiques
- a- diversité des acides gras
- b- estérification des acides gras avec des alcools
- Les lipides aromatiques : ex des stéroïdes
- II) Les rôles biologiques des lipides
- 1) Les triglycérides, des lipides de réserve énergétique
22-09-2020 : L'eau et les petites molécules organiques
Rappels sur les atomes, molécules, fonctions chimiques. Présentation de l'eau solvant et des différents types de liaisons faibles.
18-09-2020 : La vache
- IV) Quelques grandes notions à retenir
- 2. Les organes fonctionnent de manière coordonnée grâce à une communication cellulaire (fin)
- 3. La vache échange de la matière et de l’énergie avec son environnement
- 4. La vache est le résultat de la sélection naturelle et d’une sélection artificielle liée à la domestication
- 5. Différents critères permettent de placer la vache dans la classification phylogénétique
17-09-2020 : La vache
- III) La fonction de reproduction : un processus conservant l’espèce diversifiant les individus
- Vêlage et lactation
- Aspects génétiques de la reproduction, notion de sélection artificielle
- IV) Quelques grandes notions à retenir
- 1. Il existe des corrélations entre les grandes fonctions
17-09-2020 : TP3 RE, Golgi
Structure et fonction du reticulum endoplasmique et de l'appareil de Golgi.
Expérience de Palade sur la cellule acineuse du pancréas.
Observation de quelques cellules différenciées.
15-09-2020 : La vache
- II) Les fonctions de nutrition : se procurer matière et énergie par hétérotrophie
- La respiration : se procurer du dioxygène et éliminer le CO2 (fin)
- La circulation sanguine : mise en mouvement du sang par le cœur
- Excrétion : élimination des déchets métaboliques
- III) La fonction de reproduction : un processus conservant l’espèce diversifiant les individus
- Organisation des appareils génitaux mâles et femelles
- Accouplement, fécondation et gestation
12-09-2020 : DS 1h
DS (1h) : questions de cours + sujet docs sur la régulation de la volémie.
11-09-2020 : La vache
- II) Les fonctions de nutrition : se procurer matière et énergie par hétérotrophie
- La digestion chez un herbivore ruminant
- La respiration : se procurer du dioxygène et éliminer le CO2
10-09-2020 : La vache
- II) Les fonctions de nutrition : se procurer matière et énergie par hétérotrophie
- La digestion chez un herbivore ruminant
10-09-2020 : TP2 Cellules
Observation de cellules au microscope électronique : MET, MEB.
Observation de plastes (chloroplastes, amyloplastes, chromoplaste) ; plasmolyse et turgescence d'oignon rouge.
08-09-2020 : La vache
- I) Les fonctions de relation : percevoir son environnement, s’y déplacer, se protéger, communiquer (fin)
- L'immunité : une protection contre les infections (suite)
- Régulations de l'organisme face à des variations du milieu
04-09-2020 : La vache
- (suite du I)
- La perception sensorielle
- La locomotion : un animal adapté à la marche
- L'immunité : une protection contre les infections
03-09-2020 : TP1 cellules
Observation de cellules au microscope optique, techniques associées au MO.
03-09-2020 : La vache
- I) Les fonctions de relation : percevoir son environnement, s’y déplacer, se protéger, communiquer
- L’agrosystème « pâturage »