Cahier de texte

25-06-2020 : TP roches sédimentaires

A apprendre.

23-06-2020 : Ch2 Dépôts sédimentaires

2. Les ions en solution précipitent et sédimentent essentiellement en milieu marin côtier

22-06-2020 : Ch2 Dépôts sédimentaires

1. Les particules en suspension se déposent dans des conditions hydrodynamiques particulières

18-06-2020 : Ch1 Modelés des paysages et transferts de matériaux en surface

• • 2.2 Les ions sont transportés sous forme soluble
    • 2.2.1 La solubilité d’un ion est fonction de sa charge et de son rayon atomique
    • 2.2.2 Au cours d’une hydrolyse, certains ions partent préférentiellement en solution
• L’érosion est responsable du modelé des paysages
  • 3.1 Les chaines de montagnes sont des exemples de paysage sous contrôle tectonique dominant
  • 3.2 Les reliefs karstiques sont des exemples de paysage sous contrôle lithologique dominant
  • 3.3 Les vallées glaciaires sont des exemples de paysages sous contrôle climatique dominant

16-06-2020 : Ch1 Modelés des paysages et transferts de matériaux en surface

• Les matériaux en surface sont soumis à de multiples processus d’altération et d’érosion
  • 1.1 Divers facteurs physiques fragmentent les roches
  • 1.2 Divers facteurs chimiques hydrolysent ou dissolvent les minéraux des roches
  • 1.3 La part respective des facteurs physiques et chimiques dépend de la latitude
• L’érosion emporte les particules et ions solubles libérés par l’altération des roches
  • 2.1 Les particules sont transportées par la gravité, le vent ou l’eau

15-06-2020 : Fin du métabolisme

Ch5 Chimiolithotrophie

Ch6 Métabolisme azoté

11-06-2020 : Ch4 Photosynthèse

• Deux grands types photosynthétiques : les plantes en C3 et les plantes en C4
  • Une particularité physiologique liée aux propriétés de la Rubisco : la photorespiration
  • Les plantes en C4 évitent la photorespiration

 

09-06-2020 : Ch4 Photosynthèse

• La phase non photochimique de la photosynthèse : de l'ATP et des transporteurs réduits à la synthèse de matière organique
  • Mise en évidence de la fixation et de l'incorporation de CO2 : l'expérience de Calvin et Benson
  • La réduction du CO2 en matière organique : le cycle de Calvin

 

08-06-2020 : Ch4 Photosynthèse

• • Fonctionnement de la chaine photosynthétique : des réactions redox mettent en place un gradient de protons et produisent du pouvoir réducteur
  • Utilisation du gradient de protons pour la synthèse d'ATP : couplage osmo-chimique

 

04-06-2020 : Ch4 Photosynthèse

• Approche expérimentale de la photosynthèse
• Présentation de la feuille, organe photosynthétique des Angiospermes
• La phase photochimique de la photosynthèse : de l'énergie lumineuse à l'ATP et aux transporteurs réduits
  • Capture de l'énergie lumineuse par les antennes collectrices de lumière dans les membranes des thylakoïdes

 

02-06-2020 : Ch3 Mitochondrie

• III) De la réoxydation des coenzymes réduites à la synthèse d'ATP
  • 1) Le fonctionnement de l’ATP synthase grâce à un gradient de protons
  • 2) L’oxydation des coenzymes réduites (« pouvoir réducteur ») permet de créer le gradient de protons

01-06-2020 : Ch3 Mitochondrie

• I) Du pyruvate aux coenzymes réduits : le cycle de Krebs
• II) Des acides gras aux coenzymes réduits : hélice de Lynen et cycle de Krebs

28-05-2020 : Ch2 Glycolyse et fermentations

• II) Le contrôle de la glycolyse
  • 1) le contrôle exercé sur l'hexokinase (réaction 1) : voir chapitre sur les enzymes
  • 2) la PFK1 : LE site de contrôle majeur de la glycolyse (réaction 3)
  • 3) Le contrôle exercé sur la pyruvate kinase (réaction 10) : voir chapitre sur les enzymes
• III) Le devenir du pyruvate dans un milieu sans oxygène (en milieu anaérobie)

26-05-2020 : Ch2 Glycolyse et fermentations

• I) Les étapes de la glycolyse
  • 1) Une voie métabolique universelle en dix étapes
  • 2) La phase de préparation de la glycolyse
  • 3) La phase de remboursement de la glycolyse

25-05-2020 : Ch1 Généralités sur le métabolisme

• I. L'énergie d'hydrolyse de l'ATP
• II. L'énergie de gradient transmembranaire
• III. L'énergie des réactions d'oxydo-réduction

19-05-2020 : Ch2 les communications cellulaires au cours du DE

• Régionalisation de l'embryon au stade organogenèse : exemple des somites
  • 1. Formation des somites
  •  2. Régionalisation des somites selon l’axe antéropostérieur, influence des gènes homéotiques

18-05-2020 : Ch2 les communications cellulaires au cours du DE

• Induction de la régionalisation des feuillets au stade gastrula
  • 1. La régionalisation dorso-ventrale de l’embryon
  • 2. La régionalisation antéro-postérieure de l’embryon
  • 3. la régionalisation gauche-droite de l’embryon
  • 4. bilan de la mise en place du plan d’organisation primaire de l’embryon

14-05-2020 : Ch2 les communications cellulaires au cours du DE

• Importance du croissant gris dans la formation du dos de l’embryon
  • 1. Les expériences historiques menées sur le croissant gris
  • 2. Explications moléculaires : la redistribution de déterminants cytoplasmiques au niveau du croissant gris
  • 3. Equivalence des noyaux et non-équivalence des cytoplasmes au stade morula
• Induction de la formation et de la régionalisation du mésoderme au stade blastula
  • 1. Mise en évidence de l’induction du mésoderme
  • 2. Mise en évidence de l’induction de la régionalisation dorso-ventrale du mésoderme
  • 3. Identification des facteurs paracrines synthétisés par le centre de Nieuwkoop
  • 4. Modèle moléculaire de l’induction du mésoderme

12-05-2020 : Ch2 les communications cellulaires au cours du DE

• Modalités de la communication paracrine
  • 1. Utilisation de facteurs diffusant dans le milieu extracellulaire
  • 2. Notion d’induction cellulaire
  • 3. Méthodes permettant de suivre l'expression d'un gène et de qualifier ses effets phénotypiques

11-05-2020 : Ch1 du zygote à la larve chez l'Amphibien

• L'organogenèse : mise en place des organes
  • Neurulation et régionalisation de l’ectoderme
  • Régionalisation du mésoderme
  • Régionalisation de l’endoderme

05-05-2020 : Ch1 du zygote à la larve chez l'Amphibien

• La gastrulation : mise en place des trois feuillets embryonnaires
  • Définition d'un feuillet embryonnaire
  • Suivi des mouvements gastruléens : la technique des marques colorées
  • Invagination de la zone marginale et mise en place du mésoderme
  • Extension convergente du PA et mise en place de l’ectoderme
  • Rotation du PV et mise en place de l’endoderme
  • Devenir de la gastrula tardive : mise en place de la corde et des lames latérales

04-05-2020 : Ch1 du zygote à la larve chez l'Amphibien

• De l’ovocyte au zygote
  • L’ovocyte, une cellule riche en réserves
  • Fécondation et modifications de la structure de l’œuf

28-04-2020 : Chap3 Evolution des magmas, origine des séries magmatiques

• 1. L’ordre de cristallisation des minéraux au sein d’un magma est décrit par les séries de Bowen
• 2. Au sein d’une série magmatique, le magma s’enrichit en alcalins et en silice
• 3. La cristallisation fractionnée est un processus majeur guidant la différenciation magmatique

27-04-2020 : Ch2 Production des magmas

• • 2.4 Le magma produit s’extrait de la roche-mère et entame son ascension
  • 2.5 L’étude de la composition chimique des magmas peut permettre de remonter aux caractéristiques de la péridotite mère (docs commentés dans le PPT)
    • 2.5.1 Le diagramme Néodyme-Strontium
    • 2.5.2 Les diagrammes multi-élémentaires normalisés
    • 2.5.3 Modèle du manteau obtenu par étude de la géochimie des laves

24-04-2020 : Ch2 Production des magmas

• • • 2.3.2 Les diagrammes ternaires eutectiques (docs commentés dans le PPT)

21-04-2020 : Ch2 Production des magmas

• 2. La fusion partielle des roches s’accompagne d’un tri géochimique des éléments
  • 2.1 Certains éléments se concentrent dans les phases solides, d’autres dans les phases liquides
  • 2.2 Les minéraux ayant des structures proches sont miscibles (docs commentés dans le PPT)
  • 2.3 Les minéraux ayant des structures différentes sont immiscibles et présentent un comportement eutectique au cours de la fusion (docs commentés dans le PPT)
    • 2.3.1 Les diagrammes binaires eutectiques

20-04-2020 : Ch2 Production des magmas

• 1. Suivant les contextes géodynamiques, la fusion partielle des roches présente des modalités et des taux de fusion différents
  • 1.1 La fusion partielle de la péridotite se produit dans différents contextes géodynamiques
    • 1.1.1 La fusion partielle se produit lorsque le géotherme de la péridotite croise le solidus
    • 1.1.2 La fusion au niveau des dorsales et des rifts continentaux est due à une décompression adiabatique
    • 1.1.3 La fusion au niveau des points chauds est due à un échauffement isobare
    • 1.1.4 La fusion au niveau des zones de subduction est due à une hydratation
  • 1.2 La fusion partielle de la croûte continentale (anatexie) a lieu au sein des orogènes de grande dimension

02-04-2020 : Ch1 expression des magmas

• 3. Les différentes roches magmatiques d’une région restreinte peuvent former des séries magmatiques
  • 3.1 Une série magmatique peut être identifiée grâce à différents indices
  • 3.2 Une série magmatique résulte de l’évolution dans le temps d’un même réservoir magmatique

31-03-2020 : Ch1 expression des magmas

• 1. Les manifestations du magmatisme sont directes ou indirectes
  • 1.1 Les roches ou projections magmatiques constituent des manifestations directes d’une activité magmatique
  • 1.2 Le métamorphisme de contact et l’hydrothermalisme constituent une manifestation indirecte d’une activité magmatique
• 2. Les magmas sont émis dans des contextes géodynamiques variés, présentant divers types de dynamismes éruptifs
  • 2.1 Les magmas sont fréquemment émis en limites de plaques
    • 2.1.1 Les magmas émis au niveau des dorsales
    • 2.1.2 Les magmas émis au niveau des zones de subduction
  • 2.2 Les magmas peuvent aussi être émis en domaine intraplaque : le cas des points chauds et des rifts continentaux
    • 2.2.1 Les magmas émis au niveau des points chauds
    • 2.2.1 Les magmas émis au niveau des rifts et du volcanisme intraplaque

30-03-2020 : Diversification des génomes

• • Les mécanismes favorisant l'allogamie (exemple des Angiospermes)
• Les transferts horizontaux de gènes sont un autre mécanisme de diversification des génomes
  • De nombreux transferts horizontaux de gènes chez les procaryotes
  • Des transferts horizontaux de gènes chez les eucaryotes

26-03-2020 : Diversification des génomes

• (suite méiose et fécondation)
  • Le brassage inter-chromosomique : un assortiment aléatoire des chromosomes de chaque paire
  • Le brassage intra-chromosomique : des échanges de fragments de chromatides entre chromosomes homologues
  • Le hasard de la fécondation : un nouveau brassage allélique

26-03-2020 : TP fruits

Fruits charnus : baies et drupes. Fruits secs : akènes (pappus, nucule, samare) et fruits secs déhiscents (follicule, gousse, capsule).

24-03-2020 : Diversification des génomes

• Les mutations géniques créent de nouveaux allèles
  • Origines moléculaires des mutations géniques : des événements ponctuels spontanés
  • Les conséquences des mutations géniques à différentes échelles
• Des mutations de plus grande ampleur modifient les combinaisons alléliques
  • Les mutations chromosomiques
  • Les mutations affectant tout le jeu de chromosomes
• Les brassages lors de la méiose et de la fécondation créent de nouveaux assortiments d'allèles
  • La méiose : passage d'une cellule-mère diploïde à 4 cellules-filles haploïdes

19-03-2020 : Reproduction asexuée

Multiplication végétative et parthénogenèse. Les attendus :

• savoir présenter 2 modes de multiplication végétative, un avec organes spécialisés (tu peux dessiner une bulbille sur une feuille) et un sans (une raquette de figuier de Barbarie qui se détache, tombe et s'enracine)
• connaître la définition de la parthénogenèse (repro asexuée à partir d'un ovocyte non fécondé, chez les abeilles par exemple)
• énoncer les avantages de la repro asexuée : rapide, pas besoin de produire des gamètes ou des spores, évite les stades fragiles du développement (jeune plantule)
• énoncer les inconvénients : population très homogène génétiquement, vulnérabilité en cas d'arrivée d'un pathogène ou de changement du milieu.

17-03-2020 : Reproduction sexuée

• •                3. Pollinisation et fécondation chez les Angiospermes (fin)
    •                c - les barrières à l'autofécondation       
    •               d - la fleur évolue en fruit et le sac embryonnaire en graine

16-03-2020 : Reproduction sexuée

• •                3. Pollinisation et fécondation chez les Angiospermes
    •                a – pollinisation par des animaux ou par le vent
    •                b - la double fécondation des Angiospermes

13-03-2020 : Reproduction sexuée

•                II. Les modalités de rapprochement des gamètes et la fécondation
  •                1. Une fécondation externe possible en milieu aquatique
  •                2. La fécondation interne en milieu aérien
    •                a - Parade nuptiale
    •                b - Accouplement et fécondation

10-03-2020 : Soutenances Tipe

Soutenances des TIPE de sup.

09-03-2020 : Reproduction sexuée

•                I. La diversité des cycles de reproduction
  •                1. Le cycle des Mammifères Euthériens
  •                2. Le cycle d'un Filicophyte : le polypode

05-03-2020 : Réplication et mitose

• III) La mitose : une cellule-mère produit deux cellules filles identiques
  • 1- Le cycle cellulaire eucaryote
  • 2- Les particularités de la réplication (interphase S) chez les eucaryotes
  • 3- La prophase : compaction des chromosomes et formation du fuseau de division
  • 4- La métaphase : formation de la plaque métaphasique
  • 5- L'anaphase : ascension polaire des chromosomes monochromatidiens et élongation cellulaire
  • 6- La télophase : reformation des noyaux
  • 7- La cytocinèse : séparation des deux cellules-filles

04-03-2020 : Réplication et mitose

II) Conservation de l’ADN versus mutations spontanées

• 1- Le problème des bases tautomères : des mésappariements de séquences
• 2- Le système de contrôle de l’ADN Pol III garantit une haute fidélité de réplication
• 3- Les mutations ponctuelles
• 4- Les mutations étendues
• 5- Les lésions intervenant durant le stockage de l'ADN et pouvant causer des mutations
• 6- Les conséquences des mutations spontanées

02-03-2020 : Réplication et mitose

• I) Mécanismes moléculaires de la réplication
  • 1- Principe de la réplication : l’ADN polymérase III ajoute des nucléotides en 3’
  • 2- Ouverture de l’ADN et formation d’un œil de réplication
  • 3- Organisation de la fourche de réplication

02-03-2020 : Réplication et mitose

• I) Mécanismes moléculaires de la réplication
  • 1- Principe de la réplication : l’ADN polymérase III ajoute des nucléotides en 3’
  • 2- Ouverture de l’ADN et formation d’un œil de réplication
  • 3- Organisation de la fourche de réplication

27-02-2020 : TP ADN recombinant

Présentation des enzymes de restriction, des plasmides recombinants, de la fabrication de bactéries transgéniques, de la PCR, du Southern Blot et des puces à ADN. Electrophorèse d'ADN de phage digéré par différentes enzymes de restriction.

25-02-2020 : Traduction, maturation et adressage des protéines

• II. Les modifications post-traductionnelles et l'adressage des protéines
  • 1. Acquisition de la forme grâce à des protéines chaperonnes
  • 2. L'adressage des protéines néosynthétisées : présence d'une information de position
  • 3. Recyclage des protéines

24-02-2020 : Traduction, maturation et adressage des protéines

• I. La traduction : de la séquence nucléotidique à la séquence protéique
  • 1) Les acteurs de la traduction
  • 2) Initiation de la traduction
  • 3) Elongation de la chaine polypeptidique 
  • 4) Terminaison de la traduction au niveau d’un codon STOP
  • 5) Le contrôle de la traduction

03-02-2020 : La transcription et con contrôle

• I) La transcription : réalisation d’une copie mobile de l’ADN
  • 1) Principe de la transcription : rôle de la complémentarité des bases
  • 2) Initiation de la transcription : fixation sur le promoteur, intervention de facteurs de transcription
  • 3) Polymérisation des nucléotides par l'ARN polymérase II
  • 4) Terminaison : des séquences annonçant la fin de la transcription

30-01-2020 : Organisation des génomes

• III) Organisation des génomes mitochondriaux et chloroplastiques : des similitudes avec les procaryotes
  • Comparaison génome mitochondrial/génome des bactéries pourpres
  • Comparaison génome chloroplastique/génome des cyanobactéries

30-01-2020 : TP Enzymes 2

Effet du pH, de la température et de ligands sur l'activité enzymatique.

Tracé d'une cinétique michaélienne par spectrophotométrie (utilisation de la peroxydase et du gaiacol).

28-01-2020 : Organisation des génomes

• II) Le génome eucaryote nucléaire, un génome dispersé riche en séquences répétées
  • Observations de l’ADN : réalisation d'un caryotype
  • Organisation de l’information génétique nucléaire chez les eucaryotes
  • Des séquences codantes dispersées
  • La présence de gènes morcelés présentant un épissage
  • Le paradoxe de la valeur C

27-01-2020 : Organisation des génomes

• I) Le génome des eubactéries, un génome compact
  • Les supports de l’information génétique chez les procaryotes
  • Des génomes compacts
  • Les échanges de séquences entre les procaryotes : la conjugaison
  • La régulation de l’expression de l’information génétique : un système d’opérons

24-01-2020 : TP1 Enzymes

Etude de la glucose oxydase : tracé d'une cinétique michaélienne.

Rastop : étude de la carboxypeptidase A.

23-01-2020 : Les enzymes

• III. La régulation de l'activité enzymatique
  •       1. Le contrôle par les facteurs physico-chimiques : T, pH
  •       2. Le contrôle par des phosphorylations
  •       3. Le contrôle par la fixation de ligands
• IV. La nature des enzymes et des réactions qu’elles catalysent contribue à la spécialisation cellulaire
  •       1. Une cellule spécialisée sécrète des enzymes particulières, sous contrôle de l’environnement
  •       2. Les compartiments cellulaires possèdent des enzymes spécifiques

21-01-2020 : Les enzymes

• II. Les enzymes, des biocatalyseurs permettant des couplages réactionnels
  • Les enzymes diminuent l’énergie d’activation nécessaire à une réaction
  • Les enzymes michaéliennes ont une cinétique hyperbolique
  • Les enzymes allostériques ont une cinétique sigmoïde

20-01-2020 : Les enzymes

• I. Les conditions thermodynamiques de réalisation d'une transformation chimique
  •       1. Les différentes expressions possibles de ΔrG
  •       2. La nécessité de couplages réactionnels

16-01-2020 : Membranes et message nerveux

• III) La synapse : un relai chimique du message nerveux entre cellules excitables

16-01-2020 : Cartographie

Réalisation de coupes dans des terrains plissés.

14-01-2020 : Membranes et message nerveux

• II) Les potentiels d'action des cellules excitables sont à l'origine du message nerveux électrique
  • 2- Les cellules excitables ont des canaux ioniques tensiosensibles à l'origine des PA
  • 3- Propagation régénérative du potentiel d'action le long de l'axone
  • 4- Cas des neurones myélinisés

13-01-2020 : Membranes et message nerveux

• I) Le potentiel de membrane est dû à des flux ioniques transmembranaires
  • 1- Mesure d’une ddp transmembranaire sur un axone de calmar
  • 2- Le potentiel d’équilibre d’un ion dépend de facteurs chimiques et électriques (Loi de Nernst)
  • 3- Le potentiel de membrane dépend de la perméabilité sélective de la membrane plasmique
• II) Les potentiels d'action des cellules excitables sont à l'origine du message nerveux électrique
  • 1- le potentiel d'action : une ddp au décours stéréotypé se propageant sans atténuation

09-01-2020 : Cartographie

Présentation de la cartographie, réalisation de coupes dans des terrains tabulaires ou monoclinaux.

07-01-2020 : Membranes et échanges

• • 2.4. Le passage d’un soluté chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane, de sa charge et de la répartition des charges de part et d’autre de la membrane
• Les transports transmembranaires passifs ne demandent pas d’énergie
  • 3.1 La diffusion simple ne concerne qu’un nombre restreint de molécules
  • 3.2 La diffusion facilitée se fait au moyen de protéines transmembranaires
    • Les canaux, non saturables, présentent une cinétique linéaire
    • Les transporteurs saturables présentent une cinétique hyperbolique
• Les transports transmembranaires actifs demandent un apport d’énergie chimique 
  • 4.1 Les transports actifs primaires utilisent l’énergie d’hydrolyse de l’ATP
  • 4.2 Les transports actifs secondaires utilisent l’énergie de gradient

06-01-2020 : Membranes et échanges

• Les particules de grande taille ainsi que certaines molécules sont importées, transportées ou exportées grâce à la formation de vésicules cytosoliques
  • 1.1 Le trafic vésiculaire est à l’origine d’un flux de matière et de membrane au sein des cellules eucaryotes
  • 1.2 Les cytoses permettent les échanges entre la cellule et son milieu
• Des lois thermodynamiques régissent les échanges transmembranaires
  • 2.1. Les modalités thermodynamiques du passage d’une molécule à travers une membrane dépendent de plusieurs facteurs
  • 2.2. Le passage d’un soluté non chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane
  • 2.3. Le passage de l’eau dépend du potentiel hydrique

18-12-2019 : MEC et cytosquelette

• • 3- le peptidoglycane bactérien est une paroi particulière
• Les jonctions intercellulaires des cellules animales assurent des rôles diver
  • 1- Les jonctions serrées maintiennent la polarité cellulaire et limitent les flux paracellulaires
  • 2- Les jonctions GAP assurent le passage de petites molécules
  • 3- Les jonctions adhérentes assurent la cohésion des tissus
    • a- ceinture d'adhérence et desmosomes assurent l'adhérence cellule-cellule
    • b- les hémidesmosomes et points focaux assurent l'adhérence cellule-matrice

18-12-2019 : Carte de France au millionième

Carte de France au millionième : présentation des principaux territoires géologiques Bassins
sédimentaires de type tabulaire + fossés d’effondrement + bassins molassiques ; massifs récents
(Alpes et Pyrénées) ; massifs anciens (essentiellement hercyniens = varisques) ; volcanisme
quaternaire.

17-12-2019 : MEC et cytosquelette

• Les matrices extracellulaires sont des gels hydratés liés fonctionnellement aux cellules
  • 2- La matrice extracellulaire végétale désigne la paroi pecto-cellulosique et la lamelle moyenne
    • a- la cellulose forme des fibrilles résistantes
    • b- l'expansine assure la croissance irréversible de la paroi primaire
    • c- hémicellulose et pectine pontent les divers éléments de la MEC
    • d- les plasmodesmes assurent les échanges entre cellules
    • e- la lignification conduit à la mort des cellules et rigidification pariétale

16-12-2019 : MEC et cytosquelette

• Les matrices extracellulaires sont des gels hydratés liés fonctionnellement aux cellules
  • 1- La matrice extracellulaire animale est un réseau essentiellement protéique
    • a- le collagène forme des fibrilles résistantes
    • b- l'élastine et les protéoglycanes assurent l'élasticité et l’hydratation de la MEC
    • c- la fibronectine et la laminine pontent les divers éléments de la MEC
    • d- imprégnation par des composés minéraux et rigidification : ex de l'os

12-12-2019 : TD isostasie

Exercices sur les modèles d'Airy et de Pratt.

12-12-2019 : MEC et cytosquelette

• Le cytosquelette est responsable de l'architecture et de la dynamique de la cellule
  • 1- les microfilaments d'actine assurent le soutien des villosités et la motilité cellulaire
  • 2- les microtubules assurent le trafic vésiculaire, les divisions cellulaires et forment cils et flagelles
  • 3- les filaments intermédiaires type kératine assurent le soutien permanent de la cellule

11-12-2019 : TD structure interne

Exercices de tomographie sismique, construction d'un géotherme, rappels sur les roches essentielles (granite, basalte, gabbro, péridotite, grès calcaire).

03-12-2019 : Convection et dynamique des enveloppes terrestres

Origine de la chaleur interne de la Terre. Conduction et convection, établissement d'un géotherme. Circulation des enveloppes fluides.
 

02-12-2019 : Structure de la Terre

Modèle PREM (dont transitions de phase de la péridotite). Stratification de l'atmosphère et des océans.
 

28-11-2019 : Bilan sur les plans d'organisation

Histologie = peau et intestin grêle de mammifère. QCM et questions sur les plans d'organisation des animaux vus en TP. Bilan.

26-11-2019 : Risques naturels

Déf. d'un risque (aléa x enjeu x vulnérabilité). Présentation de risques liés à la géodynamique interne ou externe.

25-11-2019 : Datation en géologie

Radiochronologie : Rb/Sr, tracé d'une isochrone.

21-11-2019 : TP 10 Ecrevisse

Appareil circulatoire, appareil reproducteur, appareil digestif, chaine nerveuse (partie abdominale), dissection des appendices et rôles.

20-11-2019 : AgroParisTech

Sortie à APT : présentation des études, ferme expérimentale.

19-11-2019 : Corrigé de synthèse

Correction du DS "les macromolécules".

19-11-2019 : Datation en géologie

Datation relative. Présentation de l'échelle chronostratigraphique. Définition des ères, époques, périodes, étage (décrit par un stratotype). Caractéristiques d'un bon fossile stratigraphique.

18-11-2019 : Ressources naturelles

Notion de gisement, mine et carrière. Présentation des matériaux de construction (béton, granulats, pierres de taille...) et des ressources plus rares (hydrocarbures, métaux, uranium...).
 

14-11-2019 : AA et protéines

• • Les facteurs pouvant affecter l'activité des protéines (suite)
    • b- les facteurs chimiques : pH ou fixation d'un ligand (ex GTP sur protéine G, AMPc sur PKA)
  • Ouverture : Les lipoprotéines sont des assemblages complexes de lipides et protéines

14-11-2019 : TP9 Criquet

Place dans la classification, présentation des principaux appendices, système respiratoire (trachées), dissection des pièces buccales.
 

12-11-2019 : AA et protéines

• • Les interactions ligand-protéine s'établissent grâce à la forme spécifique des protéines
  • L'acquisition de propriétés supplémentaires grâce à une structure quaternaire
  • Les facteurs pouvant affecter l'activité des protéines
    • a- les facteurs physiques

 

07-11-2019 : TP Poisson + exercice

Corrigé de synthèse "importance biologique des liaisons faibles"

TP dissection du poisson.
 

05-11-2019 : AA et protéines

• Les protéines, des polymères présentant différents niveaux structuraux
  • Mise en évidence de l’importance de la structure d’une protéine (expérience d’Anfinsen)
  • Méthodes d'étude de la structure des protéines : diffraction aux rayons X, RMN, informatique
  • La structure primaire des protéines : un enchainement séquencé d'acides aminés
  • Les structures secondaires (hélices α et feuillets β) et les domaines fonctionnels
  • L'organisation tridimensionnelle dépend de la séquence de la protéine et détermine sa fonction
    • a- les liaisons faibles et les ponts disulfures réduisent l'agitation thermique des radicaux
    • b- les protéines peuvent avoir des domaines transmembranaires (voir cours sur les membranes)
    • c- les protéines peuvent être glycosylées : exemple d'une O-glycosylation sur sérine
  • La structure IV, un assemblage de plusieurs chaines polypeptidiques

 

05-11-2019 : TD

TD : correction de l'adipophiline.

Réflexions autour d'un sujet de synthèse "Importance biologique des liaisons faibles".
 

04-11-2019 : AA et protéines

• Propriétés des acides alpha-aminés et réalisation de la liaison peptidique
  • Les acides aminés ont un état d’ionisation dépendant du pH
  • La diversité des acides aminés repose sur les caractéristiques de leurs radicaux
  • La liaison peptidique : une liaison amide plane et peu mobile, établie par condensation

17-10-2019 : Nucléotides et AN

• Les différents ARN, relation structure-fonction (fin)
  • Les ARNr  catalysent la formation de la liaison peptidique

 

17-10-2019 : TP6-7 souris

Dissection de la souris : appareil digestif + observation du contenu du caecum, appareil uro-génital, coupe de cartilage.

15-10-2019 : Nucléotides et AN

• La double hélice d’ADN, relation structure-fonction
  • L’ADN : 2 chaines de nucléotides complémentaires
  • Le message génétique est contenu dans la séquence nucléotidique
• Les différents ARN, relation structure-fonction
  • Les ARNm, des intermédiaires mobiles entre l'ADN et la synthèse protéique
  • Les ARNt transportent les acides aminés jusqu'au lieu de la traduction

 

15-10-2019 : TD

Exercice sur les microvillosités (calcul de surface type TP de concours).

Exercice sur la symbiose zooxanthelles/corail (expérience de compétition).

14-10-2019 : Nucléotides et AN

• Les nucléotides : des molécules solubles de petite taille à rôles informationnels ou énergétiques (suite)
  • Rôles des coenzymes redox dans le métabolisme énergétique
  • Rôles de la coenzyme A dans le métabolisme énergétique
  • Polymérisation des nucléotides et formation d’une liaison 3’5’ phosphodiester

 

10-10-2019 : Nucléotides et AN

• Les nucléotides : des molécules solubles de petite taille à rôles informationnels ou énergétiques
  • Le nucléotide : une base azotée reliée à un pentose phosphorylé
  • Les nucléotides peuvent s'associer à des protéines
  • Rôle de l'ATP dans le métabolisme : une monnaie énergétique

 

10-10-2019 : TP6-7 souris

Critères de classification, dissection du bloc coeur-poumons et de l'appareil digestif.

08-10-2019 : Les glucides

• • Des polymères à rôle de structure : (suite) chitine, glycanes
  • Les polymères à rôle informationnel : glycanes

 

07-10-2019 : Les glucides

• Polymérisation des oses en macromolécules aux fonctions variées
  • Des polymères à rôle de réserve : amidon végétal, glycogène animal
  • Des polymères à rôle de structure : cellulose

 

03-10-2019 : TP5 électrophorèse et chromatographie

Colorations Biuret (protéines), liqueur de Fehling (glucides réducteurs) et rouge Soudan III (lipides).

Chromatographies sur papier (épinard, chou rouge) avec solvant polaire et solvant apolaire.

Chromatographie d'affinité, sur colonne, avec le sirop de menthe.

Electrophorèse sur bande de blanc d'oeuf et électrophorèse sur gel de maxillase, en conditions natives et dénaturantes.

Principe du Blot.

01-10-2019 : TD

Les cellules thyroïdiennes (utilisation du pulse-chase).

Petite interro sur le TP4 : protoplastes, coloration carmino-vert.

01-10-2019 : Les glucides

• Les oses sont des molécules chirales et hydrophiles
  • Les oses portent une fonction carbonyle et plusieurs fonctions hydroxyle
  • Les oses sont des molécules chirales
  • Les oses à 5 ou 6 carbones existent sous forme linéaire et cyclique
  • Les oses ont des propriétés réductrices
  • Les dérivés d'oses
• Synthèse et dégradation des oses au sein du métabolisme cellulaire
  • Les oses sont fabriqués à partir du glycéraldéhyde et de la DHAP
  • La dégradation des oses constitue une source d'énergie pour les cellules       
• Les oses réagissent par condensation et forment des diosides
  • Diversité des liaisons osidiques
  • Les diosides peuvent être réducteurs ou non
    • Les formes réductrices sont très réactives : maltose alpha, cellobiose bêta,
    • Le saccharose, dioside non réducteur, est la forme glucidique circulante privilégiée chez les plantes

 

30-09-2019 : Les lipides + bilan cellule

Bilan sur les cellules eucaryotes : notion de compartimentation, flux d'énergie et de matière, théorie endosymbiotique.

• II) Les rôles biologiques des lipides (suite et fin)
  • 3) Autres rôles des lipides

 

26-09-2019 : Les lipides

• II) Les rôles biologiques des lipides (suite)
  • 2) Les lipides de structure 
    • a- les phospholipides membranaires et le cholestérol, composants des membranes biologiques

 

26-09-2019 : TP4 Parois et membranes

Exercices sur les membranes plasmiques. Parois : réalisation de protoplastes de mâche, observation de vaisseaux lignifiés de poireau, réalisation d'une coloration carmino-vert sur une coupe de haricot. Schéma bilan final sur les cellules animales et végétales.

24-09-2019 : TD

Correction des TD "volémie" et "globules rouges infectés par le Plasmodium", ainsi que de l'exercice du TP3 sur les poils absorbants.

Retenir le principe de l'expérience de compétition.

24-09-2019 : Les lipides

• I) Les lipides, des molécules amphiphiles ou hydrophobes
  • Les lipides aliphatiques 
    • a- diversité des acides gras
    • b- estérification des acides gras avec des alcools
  • Les lipides aromatiques : ex des stéroïdes
• II) Les rôles biologiques des lipides
  • 1) Les triglycérides, des lipides de réserve énergétique

 

23-09-2019 : L'eau et les petites molécules organiques

• II. L’eau, un solvant polaire
• III. Diversité des fonctions chimiques portées par les biomolécules en lien avec leur réactivité

19-09-2019 : TP3 Reticulum endoplasmique et appareil de Golgi

Etude de l'expérience de pulse-chase + autoradiographie sur la cellule acineuse pancréatique (exp de Palade). Schéma légendé de CAPE.

Observation de paramécies et réalisation d'un frottis sanguin.

Rédaction d'un protocole pour estimer l'osmolarité des hématies.

19-09-2019 : L'eau et les petites molécules organiques

• I. Les biomolécules : des édifices atomiques nanométriques liés par des liaisons covalentes
• II. L'eau, un solvant polaire (début)

17-09-2019 : La Vache

• III) La fonction de reproduction : un processus conservatoire et diversificateur (suite)
  • 3) Vêlage et lactation
• IV) Place de la vache dans la classification phylogénétique

16-09-2019 : La Vache

• III) La fonction de reproduction : un processus conservatoire et diversificateur
  • 1) Organisation des appareils génitaux mâles et femelles
  • 2) Accouplement, fécondation et gestation

12-09-2019 : La Vache

• II) (suite)
  • 3) La circulation sanguine : mise en mouvement du sang par le cœur (fin)
  • 4) Élimination des déchets métaboliques

12-09-2019 : TP2 Les organites des cellules eucaryotes

Légende de cellules et de structures subcellulaires observées en MET.

Observation d'amyloplastes, de chromoplastes, de noyaux. Turgescence et plasmolyse de la vacuole d'oignon rouge.

10-09-2019 : La Vache

• II) suite
  • 2) La respiration : se procurer du dioxygène et éliminer le CO2
  • 3) La circulation sanguine : mise en mouvement du sang par le cœur

09-09-2019 : La Vache

• II) Les fonctions de nutrition : se procurer matière et énergie par hétérotrophie
  • 1) La digestion chez un herbivore ruminant (début, presque entier)

06-09-2019 : La Vache

• (suite du I)
  •     5) La locomotion : un animal adapté à la marche (fin)
  •     6) Le système nerveux : intégration des informations sensorielles et coordination
  •     7)  Régulations et adaptations de l'organisme face à des variations d'origine interne ou externe
    •         a- par voie nerveuse : la thermorégulation
    •         b- par voie hormonale : régulation de la glycémie

05-09-2019 : La Vache

• (suite du I)
  •     4) La perception sensorielle et la communication
  •     5) La locomotion : un animal adapté à la marche (début)

05-09-2019 : TP1 Observation de cellules au microscope optique

Définition d'une cellule (structurale, fonctionnelle).

Rappel sur les échelles du vivant + estimations de tailles au microscope optique.

Observation de cellules eucaryotes appartenant à des organismes pluricellulaires (foie de mammifère, élodée, stomates de lierre, champignon de Paris) et unicellulaires (euglènes, levures).

Coloration de Gram des bactéries du yaourt (procaryotes).

Techniques associées au microscope optique : rappel sur le fonctionnement du microscope optique de lycée, microscopie à fluorescence (GFP, immunohistochimie), microscope confocal, microscope à contraste de phase. Cytoenzymologie.

03-09-2019 : La Vache

• I) Les fonctions de relation : la vache dans son milieu de vie
  •     1) L'écosystème de la vache : le pâturage
  •     2) Les interactions intra- et inter-spécifiques
  •     3) L'immunité : une protection contre les infections

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