Cahier de texte

08-06-2018 : Ch1 Dvpt

• •        Régionalisation du mésoderme
  •        Régionalisation de l’endoderme

07-06-2018 : Ch1 Dvpt

• L'organogenèse : mise en place des organes
  •        Neurulation et régionalisation de l’ectoderme

07-06-2018 : TP Dvpt

TP développement : observation d'embryons entiers et en coupe à différents stades. Sujet 2008, thème I : mise en place du coeur chez le poisson-zèbre.

06-06-2018 : Ch1 Dvpt

• • Invagination de la zone marginale et mise en place du mésoderme
  • Extension convergente du PA et mise en place de l’ectoderme
  • Rotation du PV et mise en place de l’endoderme
  • Devenir de la gastrula tardive : mise en place de la corde et des lames latérales

05-06-2018 : Ch1 Dvpt

• La segmentation : formation d’un embryon pluricellulaire
  • La morula : divisions synchrones et absence de croissance
  • La blastula, une structure hautement organisée
• La gastrulation : mise en place des trois feuillets embryonnaires
  • Définition d'un feuillet embryonnaire
  • Suivi des mouvements gastruléens : la technique des marques colorées

01-06-2018 : Développement embryonnaire

Visualisation du film "de l'oeuf à la grenouille"

01-06-2018 : Ch1 Dvpt

• De l’ovocyte au zygote
  • L’ovocyte, une cellule riche en réserves
  • Fécondation et modifications de la structure de l’œuf

30-05-2018 : L'autotrophie

• Quelques modalités de l'autotrophie à l'azote
  • Assimilation des ions ammonium ou de l'ammoniac
  • Assimilation des nitrates

29-05-2018 : L'autotrophie

•  
  • Comparaison avec une bactérie chimiolithotrophe type Nitrobacter
  • Deux grands types photosynthétiques : les plantes en C3 et les plantes en C4

24-05-2018 : L'autotrophie

• • Fonctionnement de la chaine photosynthétique : des réactions redox
  • Utilisation du gradient de protons pour la synthèse d'ATP : couplage osmo-chimique
• La phase non photochimique de la photosynthèse : de l'ATP et des transporteurs réduits à la synthèse de matière organique
  • Mise en évidence de la fixation et de l'incorporation de CO2 : l'expérience de Calvin et Benson
  • La réduction du CO2 en matière organique : le cycle de Calvin

23-05-2018 : L'hétérotrophie

• IV) Réoxydation des coenzymes réduites et synthèse d'ATP au niveau des crêtes mitochondriales
• V) L'hétérotrophie à l'azote
  • 1) L'anabolisme des molécules azotées
  • 2) Le catabolisme des molécules azotées

23-05-2018 : L'autotrophie

• La phase photochimique de la photosynthèse : de l'énergie lumineuse à l'ATP et aux transporteurs réduits
  • Capture de l'énergie lumineuse par les antennes collectrices de lumière

22-05-2018 : L'hétérotrophie

• II) Le devenir du pyruvate avec ou sans dioxygène
  • Devenir du pyruvate en milieu anaérobie : les fermentations
  • Devenir du pyruvate en milieu aérobie : le cycle de Krebs
• III) La dégradation mitochondriale des acides gras : hélice de Lynen et cycle de Krebs
  • Les lipides, des substrats énergétiques très efficaces
  • Des acides gras à l'acétyl-CoA : l'hélice de Lynen
  • Dégradation de l'acétylCoA dans le cycle de Krebs et bilan énergétique

18-05-2018 : L'hétérotrophie

• I) La dégradation cytosolique du glucose : la glycolyse
  • phase de préparation
  • phase de remboursement
  • le contrôle de la glycolyse 

17-05-2018 : Métabolisme et formes d'énergie de la cellule

• • 3. Bilan des types trophiques
  • 4. Aperçu de la chimiolithotrophie : l'eubactérie nitratante Nitrobacter

16-05-2018 : Métabolisme et formes d'énergie de la cellule

•  
• • 2. Chez le chloroplaste, grâce à l'énergie lumineuse

15-05-2018 : Métabolisme et formes d'énergie de la cellule

• III) Le maintien du gradient de protons grâce à des chaines de transporteurs d'électrons
  • 1. Chez la mitochondrie, grâce à l'énergie d'oxydation des molécules organiques

11-05-2018 : Métabolisme et formes d'énergie de la cellule

•  
  • 4. Aperçu des conversions énergétiques dans un chloroplaste et dans une mitochondrie
• II) Les voies de synthèse de l'ATP dans la cellule
  • 1. Par phosphorylation sur substrat
  • 2. Par catalyse rotationnelle au niveau des ATP-synthases

09-05-2018 : Exercices de génétique

Exercices de dihybridisme sur des haploïdes et des diploïdes.

Corrigé du sujet de synthèse "multiplication et diversification des êtres vivants pluricellulaires au cours des phénomènes de reproduction".

04-05-2018 : Métabolisme et formes d'énergie de la cellule

• I) Les principales formes d'énergie dans la cellule
  • 1. L'énergie d'hydrolyse de l'ATP
  • 2. L'énergie de gradient transmembranaire
  • 3. L'énergie des réactions d'oxydo-réduction

03-05-2018 : TP diversification des génomes

Monohybridisme et dihybridisme chez Sordaria + exercices sur des organismes diploïdes (croisements etc.)

13-04-2018 : Diversification des génomes

• • Les mécanismes favorisant l'allogamie (exemple des Angiospermes)
• Les transferts horizontaux de gènes sont un autre mécanisme de diversification des génomes
  • De nombreux transferts horizontaux de gènes chez les procaryotes
  • Des transferts horizontaux de gènes chez les eucaryotes

12-04-2018 : Diversification des génomes

• Les brassages lors de la méiose et de la fécondation créent de nouveaux assortiments d'allèles
  • La méiose : passage d'une cellule-mère diploïde à 4 cellules-filles haploïdes
  • Le brassage inter-chromosomique : un assortiment aléatoire des chromosomes de chaque paire
  • Le brassage intra-chromosomique : des échanges de fragments de chromatides entre chromosomes homologues
  • Le hasard de la fécondation : un nouveau brassage allélique

10-04-2018 : Exercices de magmatisme

Exercices de magmatisme (taux de fusion, diagrammes binaires et ternaires, plagioclases zonés, Andes)

10-04-2018 : Botanique

Botanique : critères pour les familles des Lamiacées, Brassicacées, Astéracées, Caryophyllacées = Dianthacées.

10-04-2018 : Diversification des génomes

• Les mutations géniques créent de nouveaux allèles
  • Origines moléculaires des mutations géniques : des événements ponctuels spontanés
  • Les conséquences des mutations géniques à différentes échelles
• Des mutations de plus grande ampleur modifient les combinaisons alléliques
  • Les mutations chromosomiques
  • Les mutations affectant tout le jeu de chromosomes

06-04-2018 : Exercices magmatisme

Exercices sur les séries magmatiques (Islande).

05-04-2018 : Ch3 Séries magmatiques

Différentes séries magmatiques : tholéiitique (dorsale), alcalin (intraplaque), calco-alcalin (subduction).

05-04-2018 : TP roches magmatiques

Gabbro, basalte, andésite, trachyte, granodiorite, rhyolite, granite. Roche mantellique = péridotite. Reconnaissance raisonnée des roches et de leurs minéraux. Utilisation de la classification de Streckeisen. Exercice sur la carte de la chaine des Puys.
 

04-04-2018 : Ch3 Séries magmatiques

Fin Ch2 : Le magma reflète la composition de la péridotite mère : exemple du diagramme multi-élémentaire normalisé.

Début ch3 : processus de cristallisation fractionnée.

03-04-2018 : exos magmatisme

Diagrammes binaires et ternaires, calculs de taux de fusion, exercice sur les plagioclases zonés.

30-03-2018 : Ch2 Production et évolution des magmas

Le magma reflète la composition de la péridotite mère : exemple du diagramme Nd/Sr.

29-03-2018 : TP fruits et graines

Diversité des fruits, mode de dissémination. Identification d'homologies et de convergences évolutives.

29-03-2018 : Ch2 Production et évolution des magmas

Diagramme binaire et ternaire eutectique.

28-03-2018 : Ch2 Production et évolution des magmas

Définition des éléments lithophiles et hygromagmaphiles.

Conditions de fusion de la péridotite dans les différents contextes : point chaud, rift, dorsale, subduction. Fusion partielle du granite (anatexie) dans les chaines de montagnes.

Diagramme binaire de minéraux isomorphes (albite-anorthite).

27-03-2018 : Ch1 Modes d'expression des magmas

Présentation d'une série magmatique (chaine des Puys).

Calcul du taux de fusion à partir d'un magma basaltique.

 

23-03-2018 : Ch1 Modes d'expression des magmas

Déf de magma, roches volcaniques et plutoniques, projections pyroclastiques (bombes/scories/cendres), hydrothermalisme, filons, auréoles de métamorphisme, différents types d'édifices volcaniques.
 

22-03-2018 : TP reproduction asexuée

Multiplication végétative naturelle des Angiospermes, bases cellulaires, caractère conservateur. Evocation de la parthénogenèse et de l'agamospermie. Conséquences écologiques et évolutives de la reproduction asexuée.

20-03-2018 : La reproduction sexuée

• • •                c - les barrières à l'autofécondation       
    •                d - la fleur évolue en fruit et l'ovule fécondé en graine

19-03-2018 : La reproduction sexuée

• •                3. Pollinisation et fécondation chez les Angiospermes
    •                a – pollinisation par des animaux ou par le vent
    •                b - la double fécondation des Angiospermes

16-03-2018 : La reproduction sexuée

• • •                b - Accouplement et fécondation

15-03-2018 : La reproduction sexuée

•                II. Les modalités de rapprochement des gamètes et la fécondation
  •                1. Une fécondation externe possible en milieu aquatique
  •                2. La fécondation interne en milieu aérien
    •                a - Parade nuptiale

15-03-2018 : TP Reproduction des animaux

Fécondation d'oursin, observation de coupes de testicules et d'ovaires.

14-03-2018 : La reproduction sexuée

•  
  •                3. Le cycle d'une Angiosperme

13-03-2018 : La reproduction sexuée

•                I. La diversité des cycles de reproduction
  •                1. Le cycle des Mammifères Euthériens
  •                2. Le cycle d'un Filicophyte : le polypode

09-03-2018 : Ch3 réplication et mitose

• III) La mitose : une cellule-mère produit deux cellules filles identiques
  • 1- Le cycle cellulaire eucaryote
  • 2- Les particularités de la réplication (interphase S) chez les eucaryotes
  • 3- La prophase : compaction des chromosomes et formation du fuseau de division (achromatique)
  • 4- La métaphase : formation de la plaque métaphasique
  • 5- L'anaphase : ascension polaire des chromosomes monochromatidiens et élongation cellulaire
  • 6- La télophase : reformation des noyaux
  • 7- La cytocinèse : séparation des deux cellules-filles

08-03-2018 : Ch3 réplication et mitose

• • 4- Les mutations intervenant durant le stockage de l'ADN
  • 5- Les conséquences des mutations spontanées

08-03-2018 : TP reproduction végétale

Organisation de la fleur d'Angiospermes. Formule, diagramme et dissection de la tulipe.

Observation et cycle du Polypode.

07-03-2018 : Ch3 réplication et mitose

• II) Conservation de l’ADN versus mutations spontanées
  • 1- Le problème des bases tautomères : des mésappariements de séquences
  • 2- Le système de contrôle de l’ADN Pol III garantit une haute fidélité de réplication
  • 3- Décalage du cadre de lecture et apparition de mutations étendues

06-03-2018 : Ch3 réplication et mitose

• I) Mécanismes moléculaires de la réplication
  • 1- Principe de la réplication : l’ADN polymérase III ajoute des nucléotides en 3’
  • 2- Ouverture de l’ADN et formation d’un œil de réplication
  • 3- Organisation de la fourche de réplication

15-02-2018 : Ch2 La traduction

• • L'adressage des protéines néosynthétisées : présence d'une information de position
  • Recyclage des protéines

15-02-2018 : TP mitose

Observation de racines d'ail et de lames d'Ascaris, études de documents.

14-02-2018 : Ch2 La traduction

•  
  • Terminaison de la traduction au niveau d’un codon STOP
  • Le contrôle de la traduction
• Les modifications post-traductionnelles et l'adressage des protéines
  • Acquisition de la forme grâce à des protéines chaperonnes

13-02-2018 : Ch2 La traduction

• La traduction : de la séquence nucléotidique à la séquence protéique
  • Les acteurs de la traduction
  • Initiation de la traduction
  • Elongation de la chaine polypeptidique

09-02-2018 : TD Biotechnologies

Principes des blots, hybridation in situ, gène rapporteur, hybridation in situ, puces à ADN, KO, fabrication d'OGM.

08-02-2018 : TP ADN rec

Electrophorèse d'ADN de phage digéré par différentes enzymes de restriction. 

Présentation de la PCR et du séquençage de Sanger.

08-02-2018 : Ch2 La transcription

• III) Les maturations post-transcriptionnelles des ARN prémessagers
  •              1) l’addition d’une coiffe 5’ et d’une queue 3’polyadénylée pour les ARNm
  •              2) l’épissage des ARNm 
  •              3) l’export des ARNm du noyau vers le cytosol

06-02-2018 : Ch2 La transcription

• II) Le contrôle de la transcription chez les eucaryotes
  •       1) l’état de condensation de la chromatine : notion d'épigénétique
  •        2) les facteurs spécifiques de la transcription
  •        3) les séquences régulatrices de la transcription

05-02-2018 : Ch2 La transcription

•  
• I) La transcription : réalisation d’une copie mobile de l’ADN
  • 1) Principe de la transcription : rôle de la complémentarité des bases
  • 2) Initiation de la transcription : fixation sur le promoteur, intervention de facteurs de transcription
  • 3) Polymérisation des nucléotides par l'ARN polymérase II
  • 4) Terminaison : des séquences annonçant la fin de la transcription

02-02-2018 : Organisation des génomes

• • La présence de gènes morcelés présentant un épissage
  • Le paradoxe de la valeur C
• III) Organisation des génomes mitochondriaux et chloroplastiques : des similitudes avec les procaryotes
  • Comparaison génome mitochondrial/génome des bactéries pourpres
  • Comparaison génome chloroplastique/génome des cyanobactéries

01-02-2018 : Organisation des génomes

• • Organisation de l’information génétique nucléaire chez les eucaryotes
  • Des séquences codantes dispersées

01-02-2018 : TD Cartographie 3

Diverses coupes + réalisation de plasmides bactériens recombinants (principe).

31-01-2018 : Organisation des génomes

• • La régulation de l’expression de l’information génétique : un système d’opérons
• II) Le génome eucaryote nucléaire, un génome dispersé riche en séquences répétées
  • Observations de l’ADN : réalisation d'un caryotype

30-01-2018 : Organisation des génomes

• I) Le génome des eubactéries, un génome compact
  • Les supports de l’information génétique chez les procaryotes
  • Des génomes compacts
  • Les échanges de séquences entre les procaryotes : la conjugaison

26-01-2018 : Les Enzymes

• IV. La nature des enzymes et des réactions qu’elles catalysent contribue à la spécialisation cellulaire
  •       1. Une cellule spécialisée sécrète des enzymes particulières, sous contrôle de l’environnement
  •       2. Les compartiments cellulaires possèdent des enzymes spécifiques

25-01-2018 : Les Enzymes

• III. La régulation de l'activité enzymatique
  •       1. Le contrôle par les facteurs physico-chimiques : T, pH
  •       2. Le contrôle par des phosphorylations
  •       3. Le contrôle par la fixation de ligands

24-01-2018 : Les Enzymes

• II. Les enzymes, des biocatalyseurs permettant des couplages réactionnels
  • Les enzymes diminuent l’énergie d’activation nécessaire à une réaction
  • Les enzymes michaéliennes ont une cinétique hyperbolique
  • Les enzymes allostériques ont une cinétique sigmoïde

23-01-2018 : Les Enzymes

• I. Les conditions thermodynamiques de réalisation d'une transformation chimique
  •       1. Les différentes expressions possibles de ΔrG
  •       2. La nécessité de couplages réactionnels

19-01-2018 : Ch4 Mb : message nerveux

• III) La synapse : un relai chimique du message nerveux entre cellules excitables

18-01-2018 : Ch4 Mb : message nerveux

• III) La synapse : un relai chimique du message nerveux entre cellules excitables

18-01-2018 : TP1 cinétique

Tracé de la cinétique de la GOD (michaélienne). Linéarisation, obtention de Km et Vmax. Observation de la carboxypeptidase avec RASTOP.

17-01-2018 : Ch4 Mb : message nerveux

• • 3- Propagation régénérative du potentiel d'action le long de l'axone
  • 4- Cas des neurones myélinisés

16-01-2018 : Ch4 Mb : message nerveux

• II) Les potentiels d'action des cellules excitables sont à l'origine du message nerveux électrique
  • 1- le potentiel d'action : une ddp au décours stéréotypé se propageant sans atténuation
  • 2- Les cellules excitables ont des canaux ioniques tensiosensibles à l'origine des PA

12-01-2018 : Ch4 Mb : message nerveux

• I) Le potentiel de membrane est dû à des flux ioniques transmembranaires
  • 1- Mesure d’une ddp transmembranaire sur un axone de calmar
  • 2- Le potentiel d’équilibre d’un ion dépend de facteurs chimiques et électriques (Loi de Nernst)
  • 3- Le potentiel de membrane dépend de la perméabilité sélective de la membrane plasmique

11-01-2018 : Ch3 Membranes

• 4. Les transports transmembranaires actifs demandent un apport d’énergie chimique
  • 4.1 Les transports actifs primaires utilisent l’énergie d’hydrolyse de l’ATP
  • 4.2 Les transports actifs secondaires utilisent l’énergie de gradient

11-01-2018 : TP Cartographie

Réalisation de coupes dans des cartes au 50.000e (Corbeil,Condé sur Noireau, Lavelanet, Ste Croix, Grand Crêt d'Eau).

10-01-2018 : Ch3 Membranes et échanges

• 3. Les transports transmembranaires passifs ne demandent pas d’énergie
  • 3.1 La diffusion simple ne concerne qu’un nombre restreint de molécules
  • 3.2 La diffusion facilitée se fait au moyen de protéines transmembranaires

09-01-2018 : CH3 Membranes et échanges

• 2. Des lois thermodynamiques régissent les échanges transmembranaires
  • 2.1. Les modalités thermodynamiques du passage d’une molécule à travers une membrane dépendent de plusieurs facteurs
  • 2.2. Le passage d’un soluté non chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane
  • 2.3. Le passage de l’eau dépend du potentiel hydrique
  • 2.4. Le passage d’un soluté chargé dépend de sa différence de concentration de part et d’autre de la membrane, de sa charge et de la répartition des charges de part et d’autre de la membrane

22-12-2017 : CH3 Membranes et échanges

• Les particules de grande taille ainsi que certaines molécules sont importées, transportées ou exportées grâce à la formation de vésicules cytosoliques
  • 1.1 Le trafic vésiculaire est à l’origine d’un flux de matière et de membrane au sein des cellules eucaryotes
  •  1.2 Les cytoses permettent les échanges entre la cellule et son milieu

21-12-2017 : Ch2 Mb : MEC, cytosquelette et jonctions cellulaires

• • 2- Les jonctions GAP assurent le passage de petites molécules
  • 3- Les jonctions adhérentes assurent la cohésion des tissus
    • a- ceinture d'adhérence et desmosomes assurent l'adhérence cellule-cellule
    • b- les hémidesmosomes assurent l'adhérence cellule-matrice

21-12-2017 : TP cartographie

Cours cartographie : réalisation d'un fond de carte, carte topographique, MNT, SIG.

Notion de pendage. Failles normales, inverses et décrochantes.

Reliefs tabulaires : Neufmarché, Commercy, Mantes-la-Jolie, L'Isle-Adam

 

20-12-2017 : Ch2 Mb : MEC, cytosquelette et jonctions cellulaires

• • • d- les plasmodesmes assurent les échanges entre cellules
    • e- la lignification conduit à la mort des cellules et rigidification pariétale
  • 3- le peptidoglycane bactérien est une paroi particulière
• Les jonctions intercellulaires des cellules animales assurent des rôles divers
  • 1- Les jonctions serrées maintiennent la polarité cellulaire et limitent les flux paracellulaires

19-12-2017 : Ch2 Mb : MEC, cytosquelette et jonctions cellulaires

• • 2- La matrice extracellulaire végétale désigne la paroi pecto-cellulosique et la lamelle moyenne
    • a- la cellulose forme des fibrilles résistantes
    • b- l'expansine assure la croissance irréversible de la paroi primaire
    • c- hémicellulose et pectine pontent les divers éléments de la MEC

15-12-2017 : Ch2 Mb : MEC, cytosquelette et jonctions cellulaires

• Les matrices extracellulaires sont des gels hydratés liés fonctionnellement aux cellules
  • 1- La matrice extracellulaire animale est un réseau essentiellement protéique
    • a- le collagène forme des fibrilles résistantes
    • b- l'élastine et les protéoglycanes assurent l'élasticité et l’hydratation de la MEC
    • c- la fibronectine et la laminine pontent les divers éléments de la MEC
    • d- imprégnation par des composés minéraux et rigidification : ex de l'os

14-12-2017 : Ch1 Mb : Structure et organisation des membranes

• Une asymétrie membranaire
• Une perméabilité membranaire sélective
  • passage des gaz, des lipides et des toutes petites molécules polaires non chargées
  • nécessité de transports spécifiques pour toutes les autres molécules=> voir chapitre échanges

14-12-2017 : Ch2 Mb : MEC, cytosquelette et jonctions cellulaires

• Le cytosquelette est responsable de l'architecture et de la dynamique de la cellule
  • 1- les microfilaments d'actine assurent le soutien des villosités et la motilité cellulaire
  • 2- les microtubules assurent le trafic vésiculaire, les divisions cellulaires et forment cils et flagelles
  • 3- les filaments intermédiaires type kératine assurent le soutien permanent de la cellule

13-12-2017 : Ch1 Mb : Structure et organisation des membranes

• Mise en évidence de la composition lipido-protéique et de l'architecture de la membrane
• Mise en évidence de la fluidité membranaire 

12-12-2017 : Exos d'isostasie

Exercices d'isostasie (montagne, bassin).

08-12-2017 : Mouvements verticaux de la lithosphère

• •  
• 3. Les renseignements apportés par les anomalies gravimétriques conduisent à la théorie de l’isostasie
  • 3.1 Différents modèles d’équilibre vertical archimédien ont été proposés (Airy, Pratt, Vening-Meinesz)
  • 3.2 Des réajustements isostatiques se produisent fréquemment en domaine continental 
    • 3.2.1 Réajustement isostatique après la fonte d'une calotte glaciaire
    • 3.2.2 Réajustement isostatique et subsidence des bassins sédimentaires

07-12-2017 : TD Structure de la Terre

Reconnaissance de roches simples, construction d'un géotherme, calculs d'anomalies de Bouguer.

07-12-2017 : Mouvements verticaux de la lithosphère

• 1. Des analyses gravimétriques utilisant des données satellitales renseignent sur les hétérogénéités de masse dans le globe
  • 1.1 Différents facteurs jouent sur la pesanteur
  • 1.2. L’ellipsoïde de référence est une surface mathématiquement définie
  • 1.3. Le géoïde est la forme gravimétrique réelle de la Terre
  • 1.4 Les anomalies du géoïde par rapport à l’ellipsoïde
    • 1.4.1 Les anomalies de grande longueur d’onde du géoïde reflètent la convection profonde
    • 1.4.2 Anomalies de petite longueur d’onde du géoïde aident à cartographier les fonds marins
• 2. En domaine continental, l’étude des anomalies gravimétriques permet la modélisation de la répartition des masses dans le globe
  • 2.1 L’ellipsoïde prévoit une valeur approximative de la pesanteur (g)
  • 2.2 Trois corrections sont appliquées pour tenter d’affiner la valeur de g
  • 2.3 L’anomalie résiduelle de la valeur de g (« anomalie de Bouguer ») renseigne sur les hétérogénéités de masse en profondeur

06-12-2017 : Convection et dynamique des enveloppes terrestres

•  
  • 2.3 Les modèles de convection mantellique
  • 2.4 Etablissement du géotherme
• 3. Inégale répartition de l’énergie solaire reçue et mise en mouvement des enveloppes fluides
  • 3.1 Mise en mouvement des vents de surface
  • 3.2 Mise en mouvement des eaux océaniques

05-12-2017 : Convection et dynamique des enveloppes terrestres

• 1. Origine de la chaleur interne de la Terre : radioactivité et chaleur initiale d’accrétion
  • 2. Dissipation de la chaleur interne par conduction ou convection
  • 2.1 Transferts de chaleur au sein de la lithosphère : la conduction
  • 2.2 Transferts de chaleur au sein du manteau profond : la convection
    • 2.2.1 Mise en évidence des cellules de convection par tomographie sismique
    • 2.2.2 Modélisation mathématique de la convection : la loi de Rayleigh
    • 2.2.3 Convection mantellique et déplacement des plaques lithosphériques

01-12-2017 : La Structure de la Terre

• • 2.3. Le manteau est constitué de péridotites
    • 2.3.1. Les péridotites sont les roches constitutives du manteau
    • 2.3.2. Le manteau présente une hétérogénéité verticale
  • 2.4. Le noyau est formé d’un alliage de fer et de nickel
• 3. La Terre est entourée d’enveloppes fluides
  • 3.1. L’atmosphère planétaire est une enveloppe stratifiée
  • 3.2. L’hydrosphère, une enveloppe liquide dynamique et complexe

30-11-2017 : La Structure de la Terre

• 1. La Terre possède une structure en enveloppes concentriques
  • 1.1. Le modèle radial de la Terre : le modèle PREM
  • 1.2. Les différentes enveloppes sont séparées par des discontinuités
• 2. Les enveloppes solides sont de nature silicatée ou métallique
  • 2.1. Les minéraux constitutifs des croûtes et du manteau sont essentiellement des minéraux silicatés
  • 2.2. Les croûtes continentale et océanique sont d’épaisseurs et de natures différentes
    • 2.2.1. La croûte continentale
    • 2.2.2. La croûte océanique

29-11-2017 : TD Datation

Exercice sur la méthode K/Ar, isochrone sur roche totale ou sur minéraux après un épisode métamorphique.

28-11-2017 : TD Datation

Exercices de datation relative et absolue.

24-11-2017 : La datation

Définition de stratotype, clou d'or, biozone, taxon. Film sur l'évolution de Samba Soussoko (Laetoli productions). Datation absolue : méthode rubidium-strontium.

23-11-2017 : La datation

Principes de la datation relative, caractéristiques d'un bon fossile stratigraphique, définition des ères, frise chronologique récapitulant les principaux points de l'histoire de la Terre.

23-11-2017 : TP Ecrevisse

Chaine nerveuse et appendices de l'écrevisse.

22-11-2017 : Corrigés divers

Corrigé des schémas à faire sur les organismes disséqués.

21-11-2017 : Les risques géologiques

Définition de risque (aléa x enjeu x vulnérabilité). Séisme, éboulement ou glissement de terrain, tsunami, éruption volcanique, tempête, inondation, tornade et cyclone. Eléments de prévision et prévention.

18-11-2017 : DS Synthèse

IMPORTANCE BIOLOGIQUE DES LIAISONS FAIBLES

17-11-2017 : Les ressources géologiques

Présentation des principales ressources : eau, matériaux de construction, minerais, ressources énergétiques. Notion de gisement. Ressources locales abondantes (ex granulats) versus ressources inégalement distribuées et faisant donc l'objet d'un commerce international (ex uranium ou pétrole).

16-11-2017 : entrainement concours

Exercice type synthèse sur "les macromolécules".

16-11-2017 : TP 9 Criquet

Caractères généraux des Arthropodes, place du criquet dans la classification, dissection des pièces buccales, observation d'ommatidides, montage de trachées.

15-11-2017 : VISITE AGROPARISTECH

Visite du site de Grignon, présentation des filières, visite de la ferme expérimentale.

14-11-2017 : TD Structure de la Terre

Exercices sur les ondes, paléomagnétisme, points chauds et cinématique absolue, triangulation et épicentre du séisme, bilan de masse et composition du noyau.

14-11-2017 : Fin de la biochimie

QCM protéines + petit exercice sur les protéines. Bilan général sur les biopolymères.

10-11-2017 : Les acides aminés et protéines

• • L'acquisition de propriétés supplémentaires grâce à une structure quaternaire
  • Les facteurs pouvant affecter l'activité des protéines
    • a- les facteurs physiques : exemples température
    • b- les facteurs chimiques : pH ou fixation d'un ligand (ex GTP sur protéine G, AMPc sur PKA)
  • Ouverture : Les lipoprotéines sont des assemblages complexes de lipides et protéines

09-11-2017 : Les acides aminés et protéines

• • L'organisation tridimensionnelle dépend de la séquence de la protéine et détermine sa fonction
    • a- les liaisons faibles et les ponts disulfures réduisent l'agitation thermique des radicaux
    • b- les protéines peuvent avoir des domaines transmembranaires (voir cours sur les membranes)
    • c- les protéines peuvent être glycosylées : exemple d'une O-glycosylation sur sérine

08-11-2017 : Les acides aminés et protéines

• Les protéines, des polymères présentant différents niveaux structuraux
  • Les structures secondaires (hélices α et feuillets β) et les domaines fonctionnels
  • L'organisation tridimensionnelle dépend de la séquence de la protéine et détermine sa fonction
    • a- les liaisons faibles et les ponts disulfures réduisent l'agitation thermique des radicaux
    • b- les protéines peuvent avoir des domaines transmembranaires (voir cours sur les membranes)
    • c- les protéines peuvent être glycosylées : exemple d'une O-glycosylation sur sérine
  • La structure IV, un assemblage de plusieurs chaines polypeptidiques

07-11-2017 : Les acides aminés et protéines

• Propriétés des acides alpha-aminés et réalisation de la liaison peptidique
  • Les acides aminés ont un état d’ionisation dépendant du pH
  • La diversité des acides aminés repose sur les caractéristiques de leurs radicaux
  • La liaison peptidique : une liaison amide plane et peu mobile, établie par condensation
• Les protéines, des polymères présentant différents niveaux structuraux
  • Mise en évidence de l’importance de la structure d’une protéine (expérience d’Anfinsen)
  • Méthodes d'étude de la structure des protéines : diffraction aux rayons X, RMN, informatique
  • La structure primaire des protéines : un enchainement séquencé d'acides aminés

20-10-2017 : Nucléotides et acides nucléiques

• Les différents ARN, relation structure-fonction
  • Les ARNm, des intermédiaires mobiles entre l'ADN et la synthèse protéique
  • Les ARNt transportent les acides aminés jusqu'au lieu de la traduction
  • Les ARNr  catalysent la formation de la liaison peptidique

19-10-2017 : Nucléotides et acides nucléiques

• La double hélice d’ADN, relation structure-fonction
  • L’ADN : 2 chaines de nucléotides complémentaires
  • Le message génétique est contenu dans la séquence nucléotidique

18-10-2017 : Nucléotides et acides nucléiques

• • Polymérisation des nucléotides et formation d’une liaison 3’5’ phosphodiester

Correction du DS2 Lipides.

17-10-2017 : Nucléotides et acides nucléiques

• • Les nucléotides peuvent s'associer à des protéines
  • Rôle de l'ATP dans le métabolisme : une monnaie énergétique
  • Rôles des coenzymes redox dans le métabolisme énergétique
  • Rôles de la coenzyme A dans le métabolisme énergétique

TD : correction de la symbiose corallienne. Présentation de l'épreuve de synthèse, brainstorming sur le sujet "les glucides chez la vache et dans son environnement".

13-10-2017 : Nucléotides et acides nucléiques

Bilan sur les glucides.

• Les nucléotides : des molécules solubles de petite taille à rôles informationnels ou énergétiques
  • Le nucléotide : une base azotée reliée à un pentose phosphorylé

12-10-2017 : Les Glucides

• Polymérisation des oses en macromolécules aux fonctions variées
  • Des polymères à rôle de structure : cellulose, chitine, glycanes

12-10-2017 : TP6 Dissection de la Souris

Place de la souris dans la classification phylogénétique, fonctions de relation de la souris, appareil cardio-respiratoire, appareil digestif.
 

11-10-2017 : Les Glucides

• Polymérisation des oses en macromolécules aux fonctions variées
  • Des polymères à rôle de réserve : amidon végétal, glycogène animal

10-10-2017 : Les Glucides

• Synthèse et dégradation des oses au sein du métabolisme cellulaire
  • Les oses sont fabriqués à partir du glycéraldéhyde et de la DHAP
  • La dégradation des oses constitue une source d'énergie pour les cellules       
• Les oses réagissent par condensation et forment des diosides
  • Diversité des liaisons osidiques
  • Les diosides peuvent être réducteurs ou non
    • Les formes réductrices sont très réactives : maltose alpha, cellobiose bêta,
    • Le saccharose, dioside non réducteur, est la forme glucidique circulante privilégiée chez les plantes

10-10-2017 : TD : Plasmodium et hématies CC

Principe de la "saturation" de récepteur par des protéines recombinantes injectées dans le milieu.
 

06-10-2017 : Les Glucides

• Les oses sont des molécules chirales et hydrophiles
  • Les oses portent une fonction carbonyle et plusieurs fonctions hydroxyle
  • Les oses sont des molécules chirales
  • Les oses à 5 ou 6 carbones existent sous forme linéaire et cyclique
  • Les oses ont des propriétés réductrices
  • Les dérivés d'oses

05-10-2017 : TP5 Electrophorèse/chromatographie

Réalisation de quelques tests simples (Biuret, rouge Soudan, Liqueur de Felhling).

Réalisation d'une chromatographie sur papier (végétal vert et végétal rouge) et d'une sur billes (sirop de menthe).

Réalisation d'une électrophorèse sur bande (blanc d'oeuf) et d'une sur gel (protéines dénaturées ou non).

Connaître parfaitement le principe d'une électrophorèse dénaturante (SDS-Page) et d'un "Blot".

04-10-2017 : TD Lipide

TD sur la fluidité membranaire.

03-10-2017 : Les Lipides

Fin de correction du TD sur les cellules thyroïdiennes sécrétrices de thyroglobuline. Exercice : réalisation d'un tableau de colle sur la "comparaison Triglycéride / Phospholipide".

03-10-2017 : Les Lipides

• • 2) Les lipides de structure 
    • a- les phospholipides membranaires et le cholestérol, composants des membranes biologiques (fin)
    • b- Les cérides, composants des cires animales et végétales
  • 3) Autres rôles des lipides

29-09-2017 : Les Lipides

• I) Les lipides, des molécules amphiphiles ou hydrophobes
  • Les lipides aliphatiques 
    • a- diversité des acides gras
    • b- estérification des acides gras avec des alcools
  • Les lipides aromatiques : ex des stéroïdes
• II) Les rôles biologiques des lipides
  • 1) Les triglycérides, des lipides de réserve énergétique

28-09-2017 : Introduction à la biochimie

Condensation/hydrolyse, aldolisation, tautomérisation de bases.

 

 

28-09-2017 : TP4 Cellules

Membrane plasmique et parois pecto-cellulosiques, lignifiées ou non (observation de protoplastes, de vaisseaux xylémiens de poireau et coupe de tige ou racine avec coloration carmino-vert).

27-09-2017 : Introduction à la biochimie

Propriétés des groupements chimiques : hydrophilie, ionisation, acido-basicité, oxydo-réduction.

26-09-2017 : Introduction à la biochimie

Rappel : atome, molécule, liaison covalente, électronégativité. Propriétés de l'eau : molécule polaire, notion de liaisons hydrogènes. Autres liaisons faibles : ioniques, Van der Waals et effet hydrophobe.

 

TD sur "Ocytocine et parturition chez les Mammifères".

22-09-2017 : La Vache

• IV) Place de la vache dans la classification phylogénétique

Présentation d'une colle et d'un TIPE par une étudiante de spé.

Début du chapitre introductif à la biochimie.

21-09-2017 : La Vache

• • 3) Vêlage et lactation

Correction du DS MPB (Vasopressine et fonctionnement du rein).

21-09-2017 : TP3 Cellules

Légendes d'électronographies.

Expérience de Palade : mise en évidence du cheminement des protéines dans le RE et le Golgi par pulse-chasse et autoradiographie.

Observation de différentes cellules différenciées : frottis sanguin, paramécies, poils absorbants.

Réalisation d'une expérience d'hémolyse d'hématies (rappels sur l'osmose du TP2).

20-09-2017 : La Vache

• • 2) Accouplement, fécondation et gestation
  • 3) Vêlage et lactation (début)

19-09-2017 : La Vache

• • 4) Élimination des déchets métaboliques
• III) La fonction de reproduction : un processus conservatoire et diversificateur
  • 1) Organisation des appareils génitaux mâles et femelles

Correction de l'exercice sur les microvillosités. Adaptation d'un schéma à différents sujets de colles possibles.

15-09-2017 : TP2 - fin

Diagnose d'électronographies. Principe de la centrifugation différentielle ou en gradient de densité. Correction de l'exercice "influence des os sur le cerveau". (30 min de photo de classe)

14-09-2017 : La Vache

• • 3) La circulation sanguine : mise en mouvement du sang par le cœur

14-09-2017 : TP2 La cellule au microscope électronique

Observation d'organites en MO : plastes (chloroplastes, amyloplastes, chromoplastes), noyau (vert de méthyle), vacuole d'oignon rouge (expérience de turgescence/plasmolyse). Observation des mêmes organites en MET/MEB + mitochondries, lysosomes, peroxysomes. Principe de la cryofracture.

13-09-2017 : La Vache

 

• 2) La respiration : se procurer du dioxygène et éliminer le CO2

12-09-2017 : La Vache

• • 1) La digestion chez un herbivore ruminant (suite)

TD : correction du DM Leptine et obésité, correction du TD Thermorégulation chez les Mammifères nouveaux-nés, début du TD Influence des os sur le cerveau.

08-09-2017 : La Vache

•  
  •     7)  Régulations et adaptations de l'organisme face à des variations d'origine interne ou externe
    •         a- par voie nerveuse : la thermorégulation
    •         b- par voie hormonale : régulation de la glycémie
• II) Les fonctions de nutrition : se procurer matière et énergie par hétérotrophie
  • 1) La digestion chez un herbivore ruminant (début)

07-09-2017 : TP1 Méthodes d\'étude des cellules au microscope optique

Méthodes à connaître : microscopie optique à contraste de phase, à fluorescence et confocale ; immunohistochimie.

Observations : cellules eucaryotes animales, végétales, fongiques, euglènes, bactéries du yaourt (coloration GRAM) et cyanobactéries. Empreinte de stomates, calcul de l'indice stomatique.

07-09-2017 : La Vache

•  
  •     5) La locomotion : un animal adapté à la marche
  •     6) Le système nerveux : intégration des informations sensorielles et coordination

06-09-2017 : TD Pommes croquantes

Présentation des épreuves aux différents concours.

Exercice de TD "Des Pommes plus ou moins croquantes" (début)

05-09-2017 : La Vache

• I) Les fonctions de relation : la vache dans son milieu de vie
  •     1) L'écosystème de la vache : le pâturage
  •     2) Les interactions intra- et inter-spécifiques
  •     3) L'immunité : une protection contre les infections
  •     4) La perception sensorielle et la communication

Pour vendredi 8 : DM Leptine et obésité

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